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variantes genéticas y diferencias individualesnucleótidos snip y variaciones genéticasdeleciones y adiciones de nucleótidoshaplotipos y derivas genéticashaplotipo y variantes genéticassecuenciación de genotipo amplio gwas8500000 snips en secuenciaciónvariantes identificadas en aprotipohaplotipos y virus como h1n1herencia bloqueada de mitocondriavariantes genéticas y derivas genéticasnomenclatura haplotipo h1n1H1N1Luisa AchaerandioFélix LibicaAlberto ApariciCélulas germinalesHaplotipoLinaje maternalLuisaWill to RainFrancis VillatoroSNIPGWASADNADN antiguo
Nomenclatura haplotipo h1n1
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Luisa Achaerandio explica cómo las variantes genéticas se asocian con derivas genéticas y se heredan en bloque, comparando la nomenclatura de haplotipos con la de virus como el H1N1.
…los gatos tienen otro número, las lechugas tienen otro número y los helechos tienen, pues yo creo que era como unos mil cromosomas; es una cosa muy loca en las plantas, es un número muy loco, muy loco. Si queréis mirarlo, eso es una fantasía, de verdad. Pero esa es la base: células somáticas, diploides; células germinales, haploides, con las que se pueden establecer estos haplotipos y estas derivas. Precisamente para buscar estas derivas genéticas, bueno, yo lo definiría de otra manera: ¿Qué nos hace diferentes a unos de otros? Porque tenemos los mismos genes. Lo que nos hace diferentes son las variantes genéticas; es decir, cambios en una única letra, un SNIP, un cambio de un único nucleótido, una delección, un borrado de alguna de esas letras, la adición, el añadido de alguna letra, hay muchas variantes que incluyen varios nucleótidos, etc. Todas estas variantes es lo que se llama el aprotipo, entonces cada persona tenemos un aprotipo que es un conjunto de variantes. En SNIP por ejemplo, quiero recordar que los números actuales son del orden de 8 millones y medio o así de los que están habitualmente cuando se hace un GWAS, una secuenciación de genotipo amplio, lo que se mira básicamente son esos SNIP y son de ese orden, del orden de 8 millones y medio de variantes que son las que se han habitualmente identificado y entonces te colocan en un aprotipo. Tú para esta variante la tienes o no la tienes y cuando en una variante, como hay cuatro letras que puedes poner en el ADN en un lugar, pues tienes una letra o tienes otra o tienes otra; tienes un nucleótido o tienes otro, entonces esto te identifica dentro de, digamos, de ese, entre comillas, haplotipo. Sí, pero eso tiene que estar dentro de una variante y como va en bloque, por eso se asocia a las derivas genéticas, porque tú solamente miras determinadas secuencias, por ejemplo, de la mitocondria y por eso dice: ah, pues es el haplotipo H1N1 o lo que sea. H1N1 es de los virus de la gripe. Exactamente, va salido el virus de la gripe, pero es H no sé cuánto, HV, quiero decir, tiene también una nomenclatura de ese tipo; entonces es básicamente lo que se hereda en bloque y en la i precisamente es que se hereda en bloque de hijos a padres a abuelos o sea, básicamente es una de las cosas que yo digo de broma en clase que es que los padres, o sea que los Hombres son todos iguales, es como una broma que se hace porque ese cromosoma ahí se hereda como en bloque de hijos a padres y demás, y es como que se hace muy igual. Claro, por aportar un elemento a esto que dices, los cromosomas en el momento de crear los…
Significado #1 · Palabras #1
Luisa Achaerandio discute un problema fundamental de la paleogenómica: la conservación incompleta del ADN antiguo, lo que limita las regiones comparables.
Habla: Luisa AchaerandioPalabras #13adn antiguo conservación incompletahaplotipos humanos y paleogenómicaregiones conservadas evolutivamente…repente tiene curiosidad y le gustaría a él escribir este correo ahora mismo. No, estaría muy bien y seguro que será receptivo y le encantará, ¿no? Ya cuando publiquemos el podcast le puedes hasta enviar el link. Pues sí, sí, sí, a mí me gustaría simplemente. Decir que la paleogenómica tiene un principal problema, que es que realmente tú cuando vas a coger una muestra de ADN antiguo no se conserva en su totalidad, con lo cual puedes comparar solo de ciertas regiones; ciertas regiones que estén más conservadas, que aparte tengan la característica de que estén conservadas evolutivamente, y luego supongo, pues no sé si lo has comentado o se comenta en el artículo, pero no sé si han cogido, como en el caso de los haplotipos humanos, ciertos; pues ciertas secuencias. No sé si van por ahí los tiros, pero realmente está más relacionado, creo yo, a cómo es la dispersión del gato que realmente saber una marca histórica de cuándo se produce esa domesticación que en algunos casos diría que desde luego en algunas especies de…
Alberto Aparici responde a una afirmación anterior sobre la domesticación felina, refiriéndose a un estudio que identifica haplotipos en Félix Libica y su relación con el gato doméstico moderno.
Habla: Alberto ApariciPalabras #2haplotipos en felix líbicagato doméstico moderno y haplotiposgenomas híbridos gato montes europeoruta de domesticación felina alternativa…no se ha producido. Es como que han evolucionado con nosotros, pero como evolucionan, como tú dices, los gorriones, no necesariamente como algo que nosotros hemos relacionado porque nosotros queremos, sino como que ellos han decidido realmente estar aquí. Pues a ver, te contesto, sí que dicen algo en ese sentido, ellos identifican varios haplotipos en Félix Líbica y uno de ellos es el que está más cerca del gato doméstico moderno y los otros lo que ven es que los genomas que hibridan con el gato montes europeo son de otros haplotipos y de ahí es de donde sacan, no vino por esta ruta, tuvo que venir por otra. Pero creo recordar que mencionan 3 o 4, ya sabes que con humanos se conocen, creo que son decenas, ¿no? Y todo esto. Y fíjate, por esto que has dicho, ellos dicen explícitamente: hemos generado 70 genomas antiguos de baja cobertura. Y tenemos también, a ver cuánto han dicho, y 17 de la actualidad y de museos, ¿vale? Que también son relativamente recientes y son de museos,…
Luisa Achaerandio explica la diferencia entre células diploides y haploides, relacionándolo con las células germinales y su carga genética.
Habla: Luisa AchaerandioPalabras #3haplotipos y árboles filogenéticosvariantes genéticas definen linajesluisa define haplotipo genéticacélulas germinales y carga genéticahaplotipo y linaje maternalcromosomas diploides versus haploidesanálisis genético de luisa achaerandiohaplotipo del linaje femeninocromosoma i y pruebas…y que sí, que por ejemplo estamos hablando a nivel de limpieza de otros lugares, tendremos que cambiar de molécula y tendremos que cambiar de receptores, ¿vale? Eso en general. Perfecto, Alberto, para que nos cuentes algo, aprovechando que todavía estás. Con nosotros, no sé si serás capaz de contestar a esta pregunta: una pregunta estándar de genética pregunta, Will to Rain; no sé cómo lo querrá que lo pronuncie. Estaría bueno recordar lo que es un haplotipo, ¿te acuerdas o no? La verdad es que si lo tengo que definir de manera estricta la voy a liar seguro. Sé que es como unas ciertas variantes genéticas que definen linajes en un árbol filogenético, pero no sería capaz de decir nada más. No sé si Luis, a lo mejor, puede decirlo. A ver, las células pueden ser diploides o haploides. Básicamente cuando son células germinales es simplemente que tienen la mitad de la carga genética. Nosotros tenemos 46 cromosomas y cuando se dividen en células germinales tenemos 23. Entonces básicamente esa parte del linaje materno, por eso se le llama haplotipo porque estamos siguiendo el linaje maternal, igual que podemos hacer el haplotipo de la I Por ejemplo, yo me he hecho un análisis genético; yo quería saber qué es lo que yo portaba internamente y tú genéticamente solamente se me ve el haplotipo del linaje femenino. Evidentemente no aparece ningún haplotipo i; bueno, evidentemente no lo sé, yo no lo sabía, pero ya tengo pruebas, quiero decir. Claro, porque no tienes cromosoma i, mayormente. Exactamente, entonces pues básicamente ese es el concepto, las células. Son o diploides que tienen toda la carga, los 46 cromosomas a nivel humano, ¿vale? Humano, los gatos tienen otro número, las lechugas tienen otro número y los helechos tienen, pues yo creo que era como unos mil cromosomas; es una cosa muy loca en las plantas,…
Luisa Achaerandio explica cómo las variantes genéticas se asocian con derivas genéticas y se heredan en bloque, comparando la nomenclatura de haplotipos con la de virus como el H1N1.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #1 · Palabras #1variantes genéticas y diferencias individualesnucleótidos snip y variaciones genéticasdeleciones y adiciones de nucleótidoshaplotipos y derivas genéticashaplotipo y variantes genéticassecuenciación de genotipo amplio gwas8500000 snips en secuenciaciónvariantes identificadas en aprotipohaplotipos y virus como h1n1herencia bloqueada de mitocondriavariantes genéticas y derivas genéticasnomenclatura haplotipo h1n1…los gatos tienen otro número, las lechugas tienen otro número y los helechos tienen, pues yo creo que era como unos mil cromosomas; es una cosa muy loca en las plantas, es un número muy loco, muy loco. Si queréis mirarlo, eso es una fantasía, de verdad. Pero esa es la base: células somáticas, diploides; células germinales, haploides, con las que se pueden establecer estos haplotipos y estas derivas. Precisamente para buscar estas derivas genéticas, bueno, yo lo definiría de otra manera: ¿Qué nos hace diferentes a unos de otros? Porque tenemos los mismos genes. Lo que nos hace diferentes son las variantes genéticas; es decir, cambios en una única letra, un SNIP, un cambio de un único nucleótido, una delección, un borrado de alguna de esas letras, la adición, el añadido de alguna letra, hay muchas variantes que incluyen varios nucleótidos, etc. Todas estas variantes es lo que se llama el aprotipo, entonces cada persona tenemos un aprotipo que es un conjunto de variantes. En SNIP por ejemplo, quiero recordar que los números actuales son del orden de 8 millones y medio o así de los que están habitualmente cuando se hace un GWAS, una secuenciación de genotipo amplio, lo que se mira básicamente son esos SNIP y son de ese orden, del orden de 8 millones y medio de variantes que son las que se han habitualmente identificado y entonces te colocan en un aprotipo. Tú para esta variante la tienes o no la tienes y cuando en una variante, como hay cuatro letras que puedes poner en el ADN en un lugar, pues tienes una letra o tienes otra o tienes otra; tienes un nucleótido o tienes otro, entonces esto te identifica dentro de, digamos, de ese, entre comillas, haplotipo. Sí, pero eso tiene que estar dentro de una variante y como va en bloque, por eso se asocia a las derivas genéticas, porque tú solamente miras determinadas secuencias, por ejemplo, de la mitocondria y por eso dice: ah, pues es el haplotipo H1N1 o lo que sea. H1N1 es de los virus de la gripe. Exactamente, va salido el virus de la gripe, pero es H no sé cuánto, HV, quiero decir, tiene también una nomenclatura de ese tipo; entonces es básicamente lo que se hereda en bloque y en la i precisamente es que se hereda en bloque de hijos a padres a abuelos o sea, básicamente es una de las cosas que yo digo de broma en clase que es que los padres, o sea que los Hombres son todos iguales, es como una broma que se hace porque ese cromosoma ahí se hereda como en bloque de hijos a padres y demás, y es como que se hace muy igual. Claro, por aportar un elemento a esto que dices, los cromosomas en el momento de crear los…