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Luisa AchaerandioFrancis VillatoroHéctor SocasBorja TosarGastón Giribetenzimas bacterias degradan plásticoescherichia coli degrada petpolietileno tereftalato nanométrico petdegradación pet por escherichia coliprotocatecuato pca molécula químicabacteria reutiliza protocatecuato pcainvestigadores artículo maravillabacterias colaboran producción insulinamodificación bacterias no implica maltratoescherichia coli producción insulinacolaboración en lugar de abuso e coliEscherichia coliLuisa Achaerandiovariante S1cepa K12Francis Villatoromedio LuriaBrozAgarJuan CarlosCRISPR-CasPETPCACIMESSkyMálagaSEM
Modificación bacterias no implica maltrato
Con
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Luisa Achaerandio explica cómo los investigadores demuestran que la modificación de bacterias no implica maltrato, sino una colaboración basada en la cooperación y no en la sustitución o el abuso, haciendo referencia a su uso en la producción de insulina.
…que os digo de la triada catalítica, que se compone de tres aminoácidos, que son serina, histidina y aspartato, no confundir con aspartamo, que es un edulcorante, ¿vale? Es importante decir todo. y básicamente esta triada catalítica tú la identificas en otras Enzimas de otras bacterias que suelen que ya de manera natural pueden degradar plástico pero se la incorporas a esta bacteria en estos lugares. Con lo cual la dotas de una nueva capacidad sin que pierda sus capacidades anteriores, es decir, esta bacteria puede seguir alimentándose de manera normal o, que eso es lo chulo, puede coger el polietileno tereftalato nanométrico, es decir, nuestro conocido PET; sabía que ibas a poner esa cara porque ya os digo que lo más difícil de esta edición no es mi apellido. Y básicamente con este PET que todos conocemos pero es verdad que no lo conocemos por el nombre extendido de la molécula, pues hace capaz esta nueva capacidad, hace capaz de degradar esta molécula y llegar a obtener el protocatecuato, es decir, el PCA. PCA es una molécula que te sirve para hacer un montón de cosas a nivel químico, puedes hacer colorantes, puedes hacer fármacos, la propia bacteria la puede reutilizar, o sea que básicamente, y además una cosa muy chula también ocurre aquí, que los investigadores, ya os digo, el artículo es una maravilla, a mí me parece que está súper bien presentado, súper bien organizado y súper bien planteado y muy digamos que Te hace muy fácil su comprensión tal y como está expuesto, narrado. Entonces una cosa muy chula que te pone para que te demuestre que digamos estas bacterias no las estás maltratando, te basas en la colaboración y no en la sustitución o el abuso porque acordaros que la E. coli sirve por ejemplo para hacer insulina. Tú, utilizando un plásmido, que es una molécula de ADN circular, puedes meter un trozo de insulina, digamos, la codificación para la insulina, por así decirlo, ese gen, ¿vale? Lo metes en la bacteria con determinadas técnicas, que hay muchas técnicas para…
Significado #1 · Palabras #1
Luisa Achaerandio utiliza una metáfora para explicar cómo se están rediseñando proteínas en Escherichia coli, comparándolo con dotar a un personaje de adamantium, como en los cómics.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #12proteínas en escherichia coli adamantiumbacterias con superpoderes juan carlosdiseño bacterias mejorar no cortartecnología crispr cas guia tradicional…autoras, dice que si las proteínas nativas pueden ser rediseñadas computacionalmente para hacer algo nuevo, no necesitamos alterar el equilibrio genético de la célula con elementos externos, sino que dotamos a nuestra querida E. coli de un nuevo superpoder. es así un poquito como pensar en, lo ves, no como ser humano, pero con el adamantium. O sea, no solo puedo ser un ser humano, o en este caso una bacteria, sino tener como algo adicional, ¿no? Que efectivamente me puede alterar un poquito... Perdón, dime, dime. Estas metáforas de bacterias con superpoderes y superbacterias, no sé si escuchaste el programa con Juan Carlos en el que hacía este tipo de... Sí, de asimilar bacterias con superhéroes y tal Es que pega muchísimo, sobre todo en esta, justamente en este diseño que hacen, porque tú es como, lo que haces es mejorar, no estás cambiando, no estás cortando, no es el CRISPR -Cas, la tecnología de CRISPR-Cas con guía tradicional No es edición genética, ¿no? Efectivamente Genes que están ahí Exactamente, es una zona concreta que está ahí, que me puede servir para añadir lo que os digo de la triada catalítica, que se compone de tres aminoácidos, que son serina, histidina y aspartato, no…
Luisa Achaerandio explica cómo los investigadores demuestran que la modificación de bacterias no implica maltrato, sino una colaboración basada en la cooperación y no en la sustitución o el abuso, haciendo referencia a su uso en la producción de insulina.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #1 · Palabras #1enzimas bacterias degradan plásticoescherichia coli degrada petpolietileno tereftalato nanométrico petdegradación pet por escherichia coliprotocatecuato pca molécula químicabacteria reutiliza protocatecuato pcainvestigadores artículo maravillabacterias colaboran producción insulinamodificación bacterias no implica maltratoescherichia coli producción insulinacolaboración en lugar de abuso e coli…que os digo de la triada catalítica, que se compone de tres aminoácidos, que son serina, histidina y aspartato, no confundir con aspartamo, que es un edulcorante, ¿vale? Es importante decir todo. y básicamente esta triada catalítica tú la identificas en otras Enzimas de otras bacterias que suelen que ya de manera natural pueden degradar plástico pero se la incorporas a esta bacteria en estos lugares. Con lo cual la dotas de una nueva capacidad sin que pierda sus capacidades anteriores, es decir, esta bacteria puede seguir alimentándose de manera normal o, que eso es lo chulo, puede coger el polietileno tereftalato nanométrico, es decir, nuestro conocido PET; sabía que ibas a poner esa cara porque ya os digo que lo más difícil de esta edición no es mi apellido. Y básicamente con este PET que todos conocemos pero es verdad que no lo conocemos por el nombre extendido de la molécula, pues hace capaz esta nueva capacidad, hace capaz de degradar esta molécula y llegar a obtener el protocatecuato, es decir, el PCA. PCA es una molécula que te sirve para hacer un montón de cosas a nivel químico, puedes hacer colorantes, puedes hacer fármacos, la propia bacteria la puede reutilizar, o sea que básicamente, y además una cosa muy chula también ocurre aquí, que los investigadores, ya os digo, el artículo es una maravilla, a mí me parece que está súper bien presentado, súper bien organizado y súper bien planteado y muy digamos que Te hace muy fácil su comprensión tal y como está expuesto, narrado. Entonces una cosa muy chula que te pone para que te demuestre que digamos estas bacterias no las estás maltratando, te basas en la colaboración y no en la sustitución o el abuso porque acordaros que la E. coli sirve por ejemplo para hacer insulina. Tú, utilizando un plásmido, que es una molécula de ADN circular, puedes meter un trozo de insulina, digamos, la codificación para la insulina, por así decirlo, ese gen, ¿vale? Lo metes en la bacteria con determinadas técnicas, que hay muchas técnicas para…
Luisa Achaerandio explica cómo se modifica a Escherichia coli para degradar plástico, comparándolo con un 'toquecito molecular' en lugar de una alteración genética.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #3 · Palabras #2degradación plástica bacteria e colivariante s1 cepa k12toquecito molecular escherichia coli…con la maquinaria molecular, tú obtienes insulina que hasta ahora teníamos otras maneras de obtenerla un poquito más agresiva. Pues, en este caso, ¿pero qué es lo que pasa? Que esas bacterias, digamos, ya las estás alterando y de ahí viene lo del ADN externo. Pero aquí no, aquí es darle un toquecito a la bacteria, como si fuera eso, un toquecito molecular. Entonces, ¿cómo te demuestran que la variante S1 de la cepa K12, que es la que tiene esta modificación, va bien? Pues porque te la comparan con la que no le has hecho la modificación y entonces la cultivas. Aquí tenemos una investigación donde están mezclando un montón de tecnologías y de técnicas de laboratorio. La cultivan para aquellos que seáis de laboratorio y que estéis escuchando el podcast; seguro que os suena el medio de cultivo Luria, Broz, Agar, que…
Luisa Achaerandio describe el resultado de comparar bacterias modificadas con una variante para degradar plástico, frente a las no modificadas.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #11degradación plástica bacteria escherichia colicurva de crecimiento variante escherichia colibacterias no modificadas mueren…en el laboratorio experimentales de este tipo. Entonces la comparas con la que no tiene esta variante y crecen las dos igual; en el artículo se ve perfectamente con los gráficos. ¿Qué es lo que pasa si utilizas un medio pobre y le echas un polímero plástico? Pues lo que ocurre es que esas bacterias que tienen la variante siguen creciendo, tienen su curva de crecimiento y las que no tienen esa variante ya no se pueden alimentar y mueren. O sea que se ve muy claro con un montón de experimentos que validan su hipótesis y lo que quiere. proponer, que es ese cambio de paradigma biotecnológico para poder aprovechar la capacidad bacteriana y utilizar esta técnica que no lo he dicho Ya os digo, este artículo es que tiene un montón de cosas y sé que me voy a pasar de tiempo, pero es que si no...…
Luisa Achaerandio explica cómo las bacterias modificadas para degradar plástico atraen a otras bacterias, aprovechándose de la degradación inicial.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #17degradación plástica bacteria e colimicro nanoplásticos escala nanométricabacterias corum sensi degradación plásticabacteria modificada atrae otras bacterias…ese microscopio y el microscopio, digamos el SEM, que es el microscopio electrónico de escáner, que eso lo tenemos en Málaga, Francis seguro que también lo conoce, en el CIMES, en el Sky, lo tenemos allí y básicamente tú compruebas que eso está muy chulo. ¿Por qué claro, tú necesitas ver esto a escalas nanométricas? Estamos hablando de NPET, no estamos hablando de cualquier tipo de PET, estamos hablando de microplásticos, no, micro nanoplásticos en este caso. Una cosa muy chula que ocurre es que las bacterias son muy guays y resulta que, no sé si gracias a su corum sensi o no sé por qué, pero se ha comprobado que, claro, donde empieza esta bacteria a degradar el plástico, pues como que se añaden otras, es como que se acuden a la fiesta, por así decirlo. ¿Qué es lo que pasa? Que esas bacterias tienen en comparación, como que se aprovechan un poco de la degradación que hace esta bacteria modificada y entonces pues está también simpático esta parte del artículo. ¿Cómo? Porque ya simplemente me quedaría que se supiera, porque tú te lo estarás preguntando. ¿Pero cómo meto yo esa triada catalítica en ese binding pocket? A lo mejor se lo pregunta alguien, ¿vale? No sé si se lo pregunta alguien, pero es una cosa que…
Luisa Achaerandio explica que el proceso descrito es una prueba de concepto para la degradación del plástico por bacterias modificadas.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #19degradación plástica bacteria escherichia coliprueba de concepto bacterias modificadastécnica escalable a otros organismos…la hora de crearse en la bacteria esa triada lista para poder degradar esos pequeños trocitos de plástico que les estamos poniendo a degustar a nuestra bacteria. Pues ya os digo, eso sería a grandes rasgos toda la técnica y lo que ellos han propuesto de Gen. Rewire y lo que ya para terminar simplemente, pues me gustaría decir que en este caso digamos que es una prueba de concepto. Es verdad que tú no puedes ya utilizar estas bacterias; no se trata de que tú cojas estas bacterias y ya las pongas en el medio y nos arreglen ya todos los problemas y tal, sino que pues la puedes utilizar quizá pues a nivel, bueno se propone, ¿no? Se propone como una técnica que se puede utilizar en escalable a otros organismos, pero claro habría que probarlo y. Sobre todo pues que puedes hacer bioreactores concretos que te sirvan en un momento dado para hacer esto, y bueno pues ese es el objetivo realmente, pero no es que ya directamente se nos haya terminado el problema del microplástico sino que bueno es una forma…
Francis Villatoro introduce un resumen sobre el problema de la aversión pública hacia los organismos modificados genéticamente, específicamente en relación con las bacterias Escherichia coli.
Habla: Francis VillatoroSignificado #14 · Palabras #19aversión pública organismos modificados genéticamentebacterias escherichia coli transgénicosmodificaciones en e coli insulinavisión utilitarista bacterias…realmente, pero no es que ya directamente se nos haya terminado el problema del microplástico sino que bueno es una forma de buscar soluciones a lo que siempre parece que va a acabar con nuestra existencia y para eso está la ciencia. Si me permitís un... Bueno, pregunta, tú pregunta. No, no, di tú primero que seguro que es más interesante. Yo quería hacer un breve resumen, el problema a resolver aquí es que por razones puramente espurias y que no tienen nada que ver con la ciencia, hay una gran parte del público mundial que odia a los transgénicos y que la palabra transgénico la considera una palabra odiosa y hay que evitarlo a toda costa. Entonces tú dices, ¿modificar genéticamente una E. coli moralmente, éticamente afecta a alguien que es antitrangénico? Pues no, porque realmente la E. coli no se la va a comer ni le va a afectar en nada De hecho, se han hecho modificaciones con transgénicos para producir diferentes sustancias, insulina, etc. utilizando este tipo de bacterias Pero eso es una visión utilitarista, yo creo que mucha Gente que se opone a los transgénicos lo hace en una base casi hasta incluso de principio moral: es modificar la genética de una criatura, es jugar a ser Dios. Que bueno, eso lo podemos decir de cualquier avance tecnológico; eso es una cosa que he discutido…
Francis Villatoro explica cómo se puede modificar una bacteria para que realice dos funciones: su función original para sobrevivir y una nueva función impuesta por el investigador para consumir nanoplásticos.
Habla: Francis VillatoroSignificado #4proteínas modificadas genéticamente luisaalteración funcionamiento proteínas bacteriascatálisis función bioquímica básicasitio activo proteína modificaciónproteína bacteria funciones supervivenciabacteria consume nanoplásticos bioreactorreprogramación genética escherichia coli…que esté alterando el funcionamiento biológico de la propia bacteria y no se reproduzca bien, pierda propiedades y características. En ciertas circunstancias, deje de ser y me critiquen porque la he modificado. Lo que hago es coger una proteína que, como ha Contado Luisa, pues tiene que tener una serie de propiedades especiales para que se pueda alterar y en el sitio activo, en el lugar en el que se produce la catálisis, la función bioquímica básica de esa proteína le añado un pequeño cambio que permite que en ese sitio también se pueda hacer otra función diferente. Y entonces consigo que una proteína de la bacteria haga dos funciones: la función que hace en la bacteria para la supervivencia de la bacteria y una nueva función que es la que yo le he impuesto para que me sirva como bioreactor y haga lo que yo quiero, que en este caso es consumir nanopets, consumir nanoplásticos. Entonces esta es un poco la idea de esta nueva técnica de rewire, de recableado de la función; es algo de la biología sintética el tratar de modificar funciones que tiene la propia maquinaria celular tratando de afectar lo mínimo al funcionamiento de la propia célula para evitar que con el cambio que yo he hecho pues se crezca más lentamente o crezca peor o…