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Francis VillatoroJuan Carlos GilJosé EdelsteinGastón GiribetBorja Tosarluis maría universidad de sevillajavier buceta universidad valencia estados unidosmodelo de fuerzas javier bucetasamira primera autora tesis bucetaPedro Gómez GalvezLuis María EscuderoUniversidad de SevillaJavier BucetaUniversidad de ValenciaEstados UnidosJuanma EscuderoUniversidad de LeyesJuan Carlos GilFrancis VillatoroDe Potts-MontecarloDe Voronoi Dinámico
Modelo de fuerzas Javier Buceta
Con
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Juan Carlos Gil continúa hablando sobre los autores del artículo original sobre escutoides, mencionando a Pedro Gómez y Pablo Vicente Munuera que se encuentran en Reino Unido.
…de los autores, que voy a acostumbrar tanto asiático, difícil de pronunciar Luego, Pedro Gómez Galvez, Pablo Vicente Munuera y Luis María Escudero, que son tres de los que son el núcleo duro que firmaron el artículo original del descubrimiento desde Sevilla Y Pedro y Pablo, he dicho Pedro Gómez, Pedro y Pablo, que yo no sé si tiene algo que ver con lo de la ley de los pica piedra Cuando estaba recordando las cosas para contarlo dije Pedro y Pablo, bueno, están en Reino Unido ahora, mientras que Luis María sigue en la Universidad de Sevilla Y acaba, el último autor es efectivamente Javier Buceta, que es de la Universidad de Valencia, pero está o estaba, al menos estaba en el 2018 ahora no sé dónde está, estaba en Estados Unidos y es autor del modelo de fuerzas, ya lo hizo entonces y ahora lo extiende de forma muy chula y es director de la tesis de Samira, la primera autora de la cual forma parte este artículo Sí, según resan este nuevo artículo, su afiliación está en Valencia ahora Exacto, Bueno, pues como el artículo original más entonces todavía, pero ahora también Este trabajo supone una colaboración multidisciplinar impresionante; integra bioingeniería, física teórica, sistemas complejos, modulado computacional y aquel del 2018. Además…
Significado #1 · Palabras #1
Francis Villatoro introduce un tema fascinante sobre una nueva forma geométrica descubierta gracias a la biología, bautizada como 'escutoide', y el impacto mediático desigual entre diferentes instituciones.
Habla: Francis VillatoroPalabras #2escutoide forma geométrica biologíajuanma escudero descubridor escutoideuniversidad sevilla nota prensa escudoidejavier buceta biofísica universidad leyes…del programa Coffee Break, Señal y Ruido, su episodio, el episodio que estamos grabando, que es el episodio 2527. Teníamos en la cara a Juan Carlos y a José Edelstein y para la cara B esperamos a Gastón Giribet y Borja Tosar. Pero vamos a empezar con un tema. que yo creo que es realmente fascinante y que generó un eco absolutamente increíble en medios internacionales que es el tema de una nueva forma geométrica descubierta gracias a la biología un resultado de Juanma Escudero al que a la nueva forma bautizó como escutoide no escudeiro sino escutoide es una forma que tuvo un enorme eco en el año 2018 en julio la universidad él está en la universidad de Sevilla la universidad de Sevilla hizo una nota de prensa nadie se enteró la otro de los autores autor realmente fascinante por lo que está haciendo en biofísica, afincado en una universidad estadounidense, Javier Buceta, su universidad, la Universidad de Leyes, hizo una nota de prensa que copó todos los medios. Y un artículo publicado en Nature Communications, que fue enviado a Nature, donde fue rechazado y acabó en Nature Communications, acabó teniendo un eco mediático infinito. Apareció en televisiones, radios, prensa; hubo gente haciendo con impresoras 3D…
Juan Carlos Gil continúa hablando sobre los autores del artículo original sobre escutoides, mencionando a Pedro Gómez y Pablo Vicente Munuera que se encuentran en Reino Unido.
Habla: Juan Carlos GilSignificado #1 · Palabras #1luis maría universidad de sevillajavier buceta universidad valencia estados unidosmodelo de fuerzas javier bucetasamira primera autora tesis buceta…de los autores, que voy a acostumbrar tanto asiático, difícil de pronunciar Luego, Pedro Gómez Galvez, Pablo Vicente Munuera y Luis María Escudero, que son tres de los que son el núcleo duro que firmaron el artículo original del descubrimiento desde Sevilla Y Pedro y Pablo, he dicho Pedro Gómez, Pedro y Pablo, que yo no sé si tiene algo que ver con lo de la ley de los pica piedra Cuando estaba recordando las cosas para contarlo dije Pedro y Pablo, bueno, están en Reino Unido ahora, mientras que Luis María sigue en la Universidad de Sevilla Y acaba, el último autor es efectivamente Javier Buceta, que es de la Universidad de Valencia, pero está o estaba, al menos estaba en el 2018 ahora no sé dónde está, estaba en Estados Unidos y es autor del modelo de fuerzas, ya lo hizo entonces y ahora lo extiende de forma muy chula y es director de la tesis de Samira, la primera autora de la cual forma parte este artículo Sí, según resan este nuevo artículo, su afiliación está en Valencia ahora Exacto, Bueno, pues como el artículo original más entonces todavía, pero ahora también Este trabajo supone una colaboración multidisciplinar impresionante; integra bioingeniería, física teórica, sistemas complejos, modulado computacional y aquel del 2018. Además…
Juan Carlos Gil explica cómo se utilizan métodos no invasivos y teóricos para inferir fuerzas en epitelios, observando imágenes de monocapas celulares.
Habla: Juan Carlos GilSignificado #15 · Palabras #7método de potts-montecarlo en retículadiagramas de boronoi dinámico francismodelo de vértices y fuerzas epitelialesfuerza elástica conservación área celularanillos interiores fuerza contractilcélulas tienden a ser redonditasfuerza adhesiva entre célulasequilibrio determina la fórmula celularmodelo de vértices en tres dimensiones…se recomponen, pero esas técnicas no están tan avanzadas como para que te permitan modificar el problema del que estamos hablando. Que es las intercalaciones apicovasales; no te permiten, te hago una intercalación aquí o la cambio de sitio, eso no existe. Así que se tiende a usar métodos no invasivos, teóricos, lo que se llama inferencia mecánica observando imágenes, que en epitelios afortunadamente las tenemos porque son típicamente, y en este artículo así lo van a ser, monocapas; pues viendo la forma de las células estimar las fuerzas. Hay un método que se llama De Potts-Montecarlo que hace este trabajo en una retícula, hay uno que se llama De Voronoi Dinámico que es muy parecido a lo que ha contado Francis, pero con diferencia el más popular se llama modelo de vértices que representa un epitelio como una red de polígonos planos donde los vértices pueden moverse atendiendo a las fuerzas y tenemos tres tipos de fuerzas. La fuerza elástica, que tiende a conservar el área celular; la fuerza contractil, que es debida a los anillos interiores. De la célula de actomiosina, que tiende a reducir el perímetro. Las células tienen una tendencia por sí solas a ser más o menos redonditas, a ofrecer menos superficie. Y una fuerza adhesiva, claro, tenemos varias células juntas y por tanto en las caras compartidas pues hay allí tensión y esta fórmula, esta fuerza tiende a favorecer que se conserven esos contactos que tenemos. El equilibrio de todas ellas es lo que determina la fórmula de la célula, pues claro, es más fácil decirlo que hacerlo. Si habían hecho extensiones a tres dimensiones del modelo de vértices es muy Complicado, se había hecho de forma muy burda. Típicamente se cogían las células estas prismáticas sin curvatura ni nada y se resolvía el problema sin tener en cuenta la obvia anisotropía, cosas que ocurren a lo largo del eje apico basal. Se habían hecho…
Juan Carlos Gil explica cómo se está formulando un sistema de equilibrio de fuerzas completo, destacando que este es sobredeterminado debido a la gran cantidad de vértices considerados.
Habla: Juan Carlos GilSignificado #2sistema equilibrio de fuerzas sobredeterminadofuerzas elásticas contractiles y adhesivastécnica para búsqueda de fuerzas…largo del eje apico-basal, que es una aproximación perfectamente razonable de lo que sabemos experimentalmente de los epitelios, pero lo que sí varía y es lógico es la contractilidad, y ese es uno de los targets que vamos a tratar de obtener en el análisis. Se formula el sistema de equilibrio de fuerzas completo, hay que darse cuenta de que es un sistema fuertemente sobredeterminado porque tenemos vértices para aburrir pero estamos buscando solamente fuerzas elásticas contractiles y adhesivas que son vectores en cara a cara, o sea que hay muchos menos y por tanto lo que hacen es emplear una técnica para buscar la solución óptima, pues una técnica de optimización, de minimización del error total absoluto, lo que se llama la norma L1, en vez de los mínimos cuadrados, pues minimizan la suma del valor absoluto de las diferencias. Lo que, después de todo este rollo, les…