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Sara RobiscoJuan Carlos GilHéctor SocasGastón Giribetmicroorganismos en muestras de aguapartículas en suspensión placamovimiento rápido microbios aguavelocidad microorganismos en el espaciocapturadora de imagen rápidadetector imágenes machine learningrecursos equipo pesado sara robiscomicromembranas atraen microorganismosquimiofector atrae bacterias robiscomovimiento hacia el quimiofactorbacterias con movilidad atraviesan membranaMachine LearningEspacioSara RobiscoMicroorganismosBacillus subtilisPseudohalteromonas aloplantisAloferax volcaniAlloplanctisB. subtilisPealoplantisMarte
Membranas para capturar microorganismos
Con
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Sara Robisco explica la dificultad de capturar microorganismos en el espacio debido a su rápida velocidad.
…tenéis un microscopio en casa y si no estáis tardando. Cuando coges una gota de agua de dudosa procedencia, cualquiera para investigar, ¿qué podemos hacer una cosa, un juego con los oyentes? Podéis contarnos en redes sociales de dónde habéis cogido muestras. ¿Y qué habéis visto? Bueno, pues cuando cogemos esas gotas de agua, las ponemos en la placa y observamos los microbios, pues tenemos varias cosas: partículas en suspensión y los microbios, ¿no? ¿Y qué pasa con los microbios? Que todos vemos que cruzan como súper rápido, y luego otro por ahí, van como locos, ¿no? Entonces claro se les ocurrió porque esto tiene un problema. Esa velocidad y es que si tú tomas una muestra en el espacio para estar detectando estos seres vivos a esa velocidad que se mueven, necesitarías una capturadora de imagen muy, muy rápida que sea capaz de pillarlos en ese momento. Un detector de imágenes por Machine Learning muy potente que consumiría muchos recursos, entonces tendrías que tener un equipo muy pesado, muy potente y eso no es viable, entonces dice esta gente: vale, tenemos que crear algo para pillarlos, dice: oye, ¿Y si los pillamos quietecitos una vez que los atrapamos? ¿Cómo los atrapas? Pues esta es la cuestión: se les ha ocurrido un invento que consiste en dos cámaras separadas por unas micromembranas de tal forma de que tú pones tu trozo de sedimento en una parte de la cámara, en un lado de la membrana y en otro pones un elemento que lo vamos a llamar el quimiofector, que lo que provoca es que haya un movimiento hacia él. Las bacterias se sienten atraídos, los microbios se sienten atraídos hacia él de una forma salvaje. Entonces es fácil, ¿por qué? Porque solo aquellos seres que están vivos y tienen movilidad pueden atravesar la membrana y acabar en el quimiofactor. Es una aproximación barata y sobre todo es una idea. muy buena. Entonces, ¿qué necesitas para detectar esas bacterias? Un sistema de machine learning muy sencillo, un detector de gota, un detector de hay, no hay, además binario, un clasificador; entonces te reconoce los microbios, tenga la forma que tengan,…
Palabras #1
Sara Robisco explica la dificultad de capturar microorganismos en el espacio debido a su rápida velocidad.
Habla: Sara RobiscoPalabras #1microorganismos en muestras de aguapartículas en suspensión placamovimiento rápido microbios aguavelocidad microorganismos en el espaciocapturadora de imagen rápidadetector imágenes machine learningrecursos equipo pesado sara robiscomicromembranas atraen microorganismosquimiofector atrae bacterias robiscomovimiento hacia el quimiofactorbacterias con movilidad atraviesan membrana…tenéis un microscopio en casa y si no estáis tardando. Cuando coges una gota de agua de dudosa procedencia, cualquiera para investigar, ¿qué podemos hacer una cosa, un juego con los oyentes? Podéis contarnos en redes sociales de dónde habéis cogido muestras. ¿Y qué habéis visto? Bueno, pues cuando cogemos esas gotas de agua, las ponemos en la placa y observamos los microbios, pues tenemos varias cosas: partículas en suspensión y los microbios, ¿no? ¿Y qué pasa con los microbios? Que todos vemos que cruzan como súper rápido, y luego otro por ahí, van como locos, ¿no? Entonces claro se les ocurrió porque esto tiene un problema. Esa velocidad y es que si tú tomas una muestra en el espacio para estar detectando estos seres vivos a esa velocidad que se mueven, necesitarías una capturadora de imagen muy, muy rápida que sea capaz de pillarlos en ese momento. Un detector de imágenes por Machine Learning muy potente que consumiría muchos recursos, entonces tendrías que tener un equipo muy pesado, muy potente y eso no es viable, entonces dice esta gente: vale, tenemos que crear algo para pillarlos, dice: oye, ¿Y si los pillamos quietecitos una vez que los atrapamos? ¿Cómo los atrapas? Pues esta es la cuestión: se les ha ocurrido un invento que consiste en dos cámaras separadas por unas micromembranas de tal forma de que tú pones tu trozo de sedimento en una parte de la cámara, en un lado de la membrana y en otro pones un elemento que lo vamos a llamar el quimiofector, que lo que provoca es que haya un movimiento hacia él. Las bacterias se sienten atraídos, los microbios se sienten atraídos hacia él de una forma salvaje. Entonces es fácil, ¿por qué? Porque solo aquellos seres que están vivos y tienen movilidad pueden atravesar la membrana y acabar en el quimiofactor. Es una aproximación barata y sobre todo es una idea. muy buena. Entonces, ¿qué necesitas para detectar esas bacterias? Un sistema de machine learning muy sencillo, un detector de gota, un detector de hay, no hay, además binario, un clasificador; entonces te reconoce los microbios, tenga la forma que tengan,…
Sara Robisco continúa explicando el proceso de experimentación, detallando que los investigadores han reproducido un experimento previo y se enfrentan a desafíos como la selección de membranas adecuadas para capturar microorganismos.
Habla: Sara RobiscoSignificado #1membranas para capturar microorganismosbacillus subtilis experimento reproducidopseudohalteromonas aloplantis selección membranasarquea aloferax volcani desafío experimentación…una potencia de cálculo enorme, simplemente con un PC chiquitito te va el día. Entonces esa aproximación es muy buena, pero claro, como decimos, de dicho al hecho hay un trecho; entonces esta gente en su trabajo se lo pasaron muy bien. ¿Qué han hecho? Han reproducido el experimento porque además y han descubierto otro problema. Dice: vale, ¿qué membrana elegimos? ¿y con qué bacterias, con qué microbios practicamos? Pues los he hecho spoiler varias veces y han elegido tres bacterias: han cogido Bacillus subtilis, Pseudohalteromonas aloplantis y una arquea, dos bacterias y una arquea, la arquea Aloferax volcani. ¿Y ¿Por qué las han elegido? Pues es muy curioso, porque esta gente se ve que son biólogos, entonces han hecho un estudio de bacterias y arqueas y han descubierto que Bacillus subtilis es un bacilo que se encuentra en todo el suelo repartido por toda la tierra.…
Sara Robisco introduce el experimento para detectar vida en Marte, señalando que puede generar confusión debido a las variables desconocidas sobre las bacterias marcianas.
Habla: Sara RobiscoSignificado #11bacterias marcianas medidas desconocidasmembrana semiperneable grosores distintossuelo marciano centrifugado muestras flotantesquimiofector comidita para bacterias…ahí sería que fuera el 0%, o sea, que realmente la vida en Marte hubiera sido tal que toda ella absolutamente se queda quieta para la foto O que esté extinta, que hubiese estado y que ya está Claro, que eso también, este experimento ayudaría un poco, ¿no? Pero vamos al experimento porque parece que da un poquito de margen de confusión, ¿no? Porque realmente ellos no fotografían imágenes en movimiento esta semimembrana semiperneable que ponen en medio tienen varias han probado con distintos tipos de grosores porque claro no conocemos es muy divertido no conocemos las bacterias que puede haber en Marte no conocemos sus medidas entonces claro ponen los dos medios a tierra el suelo lo sacuden mucho lo menean centrifugan y oponen las bacterias toman muestras de lo que flota y lo van depositando en una membrana de las cámaras y aquello que se pasa a través de la membrana al quimiofector se queda quieto. ¿Por qué? Porque ya tiene comidita. Y una cosa que no he dicho, la segunda bacteria que he descrito, Pealoplantis, se empezó poniendo en el estudio como control porque no se siente atraída por este quimiofector. al contrario, los estudios hasta ahora demostraban que le repelía, entonces dijeron…
Sara Robisco explica cómo Pealoplantis, utilizada como control en un experimento para detectar vida en Marte, reacciona al quimiofector al atravesar la membrana.
Habla: Sara RobiscoSignificado #9pealoplantis detecta vida en martequimiofector reacción membrana pealoplantisalloplanctis cinco seis horasb subtilis muchas horas…Pealoplantis, se empezó poniendo en el estudio como control porque no se siente atraída por este quimiofector. al contrario, los estudios hasta ahora demostraban que le repelía, entonces dijeron vamos a ponerla porque le arrepele, vamos a ver qué pasa Bueno, pues ¿qué pasa? Que cuando atraviesan la membrana y se van al quimiofector se quedan quietas. Dicen: esto es para mí, esto es para mí; pues ya me quedo quietecita, ya no me muevo más, y ese es el momento de hacer una única foto que puede ser una a la hora y otras tres horas porque se ha estudiado que estas bacterias a partir de cinco o seis horas en el caso de Alloplanctis y me parece que muchas más horas en B. subtilis empiezan ya a crear. Colonias y no les interesa esas colonias y les quieren ver el microorganismo que ha llegado. Entonces, según se posan a la hora, hay una primera foto a cabo de una hora y otra a las tres horas y detectas las bacterias, los elementos que hay y los cuentas.…
