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Luisa AchaerandioBorja TosarFrancis VillatoroHéctor SocasMaría Ribesviroides infectan plantasobeliscos evolución de la naturalezaluisa achaerandio explica viroidesobeliscos más grandes que viroidesproteínas propias en obeliscosribocimas en los obeliscosenzimas de obeliscos hospedadoresmicrobiomas humanos y obeliscosViroidesPlantasObeliscosLuisa AchaerandioHéctor SocasCELMicrobioma humanoARNMarcos de la PeñaUniversidad de Valencia (UPV)Open frameMicrobiomas humanosProteínasRibocimasCEDCSICViroideOpen Frame ReadHarbor Ribocimas
Luisa Achaerandio explica Viroides
Con
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Luisa Achaerandio continúa explicando las características de los viroides y su relación con los obeliscos, después de que Héctor Socas interviniera para aclarar la naturaleza de los viroides.
…cientos de nucleótidos, además en forma circular, que no tiene extremos porque está todo conectado y eso lo hace un poquito más estable y que infecta células de plantas y dentro de las células se puede No, no, perdona, perdona Héctor No, no, los viroides son Los que infectan Plantas. Digamos plantas, pero los obeliscos es como si fuera una especie de evolución de la naturaleza. Los obeliscos ya se ha demostrado. Sí, pero yo soy los viroides. Ah, vale, los viroides en sí, vale, vale, ok. Sí, los viroides sí infectan plantas. Vale, vale, y luego los obeliscos son como un paso un poco más, son más grandes, ¿no? Eso es. Y ahí, ¿sigue entonces con la explicación ahí? Eso, son un poquito más grandes y no solo es que sea un poquito más grande, sino que además añaden proteínas propias y ribocimas; es decir, que tienen unas enzimas que una vez que entran en los hospedadores, que ya son diferentes a las plantas; ya no son plantas. Ya se han encontrado en microbiomas humanos y hemos dicho que hemos hablado de microbioma humano, entendiendo como microbioma humano, por ¿Concretar esto: heces o saliva? Y en concreto hay una bacteria concreta que sí se ha logrado discriminar, que ese sea su hospedador, que es el *Heces sanguinis*. Eso sí también lo pone en el artículo. Y luego me faltaría hablar del otro preprint, pero que…
Significado #1 · Palabras #1
Luisa Achaerandio se muestra dispuesta a explicar conceptos complejos de bioquímica como replicones, viroides y obeliscos, aunque reconoce que no es su especialidad y busca ofrecer una explicación lo más precisa posible. Menciona un descubrimiento reciente de una nueva entidad biológica por parte del CSIC.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #15descubrimiento entidad biológica csicnueva entidad biológica cuerpo humanoobeliscos descubrimiento reciente…unas historias que yo como no entiendo de biología ni de bioquímica ni nada de esto me vuela la cabeza. Me hablabas de replicones y de viroides y de obeliscos, que son descubrimientos relativamente nuevos de la bioquímica y que me gustaría que nos explicaras. Un poco. Ha habido avances recientes además con el descubrimiento de estos obeliscos y tal. Pues sí, tengo la responsabilidad de contarlo lo mejor posible, que tampoco es mi especialidad, pero sí me gustaría hacerlo lo más aproximado posible. Entonces, lo primero que quería decir es que hace casi un año, desde ahora, un miércoles 30 de octubre en el 2024 sale una nota de prensa del CSIC donde dicen que descubren una nueva entidad biológica que habita en el cuerpo humano ni más ni menos. Entonces, ¿cómo te quedas con esto? Yo me acuerdo que estaba... Exorcista, porque... Claro, te parece que, bueno, se generó un gran revuelo porque realmente me acuerdo que estaba en clase, yo normalmente soy docente de formación profesional sanitaria y, bueno, pues soy conocida porque me gusta,…
Luisa Achaerandio recomienda un artículo sobre colonias similares a viroides encontradas en el microbioma humano, explicando que se traducen como 'viroid-like colonies of human microbiomes'.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #5 · Palabras #2viroid-like colonies microbioma humanoelementos heredables de arn cel 2024muestras del microbioma humanoconcepto viroide agentes heredables arnestructura arn escalón pequeñoagente infeccioso plantas viroidemacromolécula biológica ajuste finoarn circular celmarco de lectura proteínaribocimas martillo harborenzimas ribocimas replicaciónviroides sin open framemarco de lectura abierto viroidesluisa achaerandio y viroides…estuvieron en La Revuelta, en Radio Televisión Española. Es verdad que viendo, por ejemplo, nada más que parándote con el nombre de Marcos de la Peña, aparece en X y creo que aparece justo como un pequeño clip de vídeo donde se ve en ese programa, ¿sabes? Hablando precisamente de la importancia de la ciencia, vale, pues nada más que el artículo, yo lo recomiendo que lo veáis porque es un artículo muy bonito. Es un artículo que claramente ya te dice con el título de qué estamos hablando, que supongo que lo aportaremos en las notas del episodio, pues como siempre, ya te lo está aclarando, te dice Viroid-like colonies of human microbiomes, o como se pronuncia. Pues básicamente se traduce como unos microbiomas, o sea, en el microbioma humano, es decir, dentro, en concreto, utilizando o extrayendo muestras del microbioma humano se han encontrado unos colonizadores que se parecen, B-Joid-like, se parecen a unas entidades, por así llamarlo, o como lo llaman en este artículo del CEL de 2024, lo llaman elementos heredables de ARN, agentes o elementos genéticos. ¿Esto qué significa? Pues a lo mejor hay que empezar por el concepto de viroide, que digamos es un escalón un poco más pequeño de estructura de ARN. Ya te digo, aquí me he encontrado yo que no sabía bien si empezar desde el principio a principio o simplemente pues centrarme en este punto de lo que era un viroide en sí. Un viroide básicamente es un agente infeccioso para plantas, como se puede entender generalmente ¿vale? Es como se le conoce de manera general y digamos que su forma y comportamiento se parece mucho a este nuevo agente heredable, pero no del todo. Esto digamos que es un ajuste fino a la hora de poder diferenciar un agente biológico de otro en realidad una macromolécula biológica o una biomolécula de otra ¿vale? Estamos hablando de un ajuste fino. ¿En qué se diferencian? Pues como os decía en el artículo del CEL se ve clarísimo. Es un ARN circular, básicamente, que yo tengo aquí un dibujito que se ve muy claro, donde la diferencia con un viroide es que tiene un Open Frame Read, que es básicamente un marco de lectura, es decir, que se tiene en su interior la información para traducir una proteína muy concreta con la que se le pueda identificar y también porta ribocimas, ribocimas en forma de martillo que se le llama, ¿vale? Harbor Ribocimas, ¿vale? Son básicamente unas enzimas que en el momento en el que este agente infeccioso se introduce en su huésped utiliza esa maquinaria celular para crear estas ribocimas y poder replicarse. Entonces se diferencia precisamente en eso, en que si hablamos de viroides no estamos hablando de una biomolécula que tenga ese open frame, ese marco de lectura abierto. No tiene esa capacidad de identificarse con unas proteínas concretas y pues eso básicamente es como una diferencia como muy fundamental, pero ¿por qué digo yo que hay que ir al ajuste fino? Porque esto no es posible identificarlo con nuestros ojos, no es lo mismo diferenciar un perro de un pollo, por así decirlo, si estamos hablando de seres, que una biomolécula de otra y para eso, pues que me corrija evidentemente Francis, que es el que sabe…
Luisa Achaerandio explica cómo las técnicas de laboratorio para analizar biomoléculas deben complementarse con bioinformática para comparar secuencias de ARN o proteínas con bases de datos existentes.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #7bioinformática para secuencias de arnsecuencia de aminoácidos en base de datoshomologías entre proteínas y viroidesartículo cel del 2024…estaríamos extrayendo ARN, ¿vale?, ácido ribonucleico de ese microbioma humano en concreto de las heces y de la saliva. Y para ello necesitan muchas técnicas de laboratorio, entre las que se encuentran pues Northern Plot y técnicas muy concretas, ¿vale? entonces una vez que ya lo tienes digamos estas técnicas de laboratorio se tienen que complementar con técnicas de bioinformática que básicamente es trasladar esa secuencia de aminoácidos partimos de la ARN o de las proteínas que encontremos en una muestra y esa secuencia de aminoácidos hay que pasarla a una base de datos y compararla pues con secuencias anteriores que tenemos tanto de nucleótidos como de proteínas y en ese proceso de comparación se pueden establecer lo que se llaman homologías por ejemplo con las proteínas o secuencias parecidas y se puede digamos que sacar un parecido o una diferencia entre este viroide que te digo y lo que se ha descubierto nuevo y se establece como nuevo. De hecho, en el artículo del CEL del 2024, Es el artículo en el que se le llama por primera vez obelisco. Y tiene que ser muy emocionante, realmente, ponerle el proceso ahora mismo en vivo de ponerle el nombre a una entidad biológica que realmente es nueva, pero que necesita todo este proceso tan…
Luisa Achaerandio continúa explicando las características de los viroides y su relación con los obeliscos, después de que Héctor Socas interviniera para aclarar la naturaleza de los viroides.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #1 · Palabras #1viroides infectan plantasobeliscos evolución de la naturalezaluisa achaerandio explica viroidesobeliscos más grandes que viroidesproteínas propias en obeliscosribocimas en los obeliscosenzimas de obeliscos hospedadoresmicrobiomas humanos y obeliscos…cientos de nucleótidos, además en forma circular, que no tiene extremos porque está todo conectado y eso lo hace un poquito más estable y que infecta células de plantas y dentro de las células se puede No, no, perdona, perdona Héctor No, no, los viroides son Los que infectan Plantas. Digamos plantas, pero los obeliscos es como si fuera una especie de evolución de la naturaleza. Los obeliscos ya se ha demostrado. Sí, pero yo soy los viroides. Ah, vale, los viroides en sí, vale, vale, ok. Sí, los viroides sí infectan plantas. Vale, vale, y luego los obeliscos son como un paso un poco más, son más grandes, ¿no? Eso es. Y ahí, ¿sigue entonces con la explicación ahí? Eso, son un poquito más grandes y no solo es que sea un poquito más grande, sino que además añaden proteínas propias y ribocimas; es decir, que tienen unas enzimas que una vez que entran en los hospedadores, que ya son diferentes a las plantas; ya no son plantas. Ya se han encontrado en microbiomas humanos y hemos dicho que hemos hablado de microbioma humano, entendiendo como microbioma humano, por ¿Concretar esto: heces o saliva? Y en concreto hay una bacteria concreta que sí se ha logrado discriminar, que ese sea su hospedador, que es el *Heces sanguinis*. Eso sí también lo pone en el artículo. Y luego me faltaría hablar del otro preprint, pero que…
Luisa Achaerandio ha explicado el origen y hallazgo de los 'obeliscos' en diferentes entornos, incluyendo la saliva y aguas termales, y ahora se abre un espacio para preguntas sobre su función.
Habla: Luisa AchaerandioPalabras #8investigaciones sobre obeliscos de achaerandioartículo ced del 2024 sobre obeliscosorigen y hallazgo de obeliscos…la saliva, que se encuentra en la saliva, sino que también ha sido encontrada en estos aguas termales. Curiosamente se abren muchísimo más los lugares donde este colonizador puede llegar a estar, pero sigue habiendo esa duda de realmente cuál es su función. Y eso precisamente es el punto de partida de futuras investigaciones. Interesante, pues muy bien, muchas gracias Luisa. No sé si alguien tiene alguna pregunta o algo, pero me parece un tema fascinante. Puedo hacer una pregunta muy tonta: ¿Por qué el nombre? Me encanta que me lo digas porque realmente es algo que yo creo que es la pregunta como más rápida, pero también tiene su relevancia y básicamente si te vas al artículo del CED del 2024 es cuando los autores. Por la forma de ARN mensajero que está cerrado covalentemente y que tiene esa forma de varilla, hombre, podían haberle puesto “varilla” pero quedaba como mucho menos atractivo. Entonces decidieron ellos de manera personal decir: bueno pues tengo la…
Luisa Achaerandio interrumpe la discusión sobre la definición de vida para señalar que una definición ya ha sido planteada y se encuentra disponible en el capítulo, que consta de 16 páginas.
Habla: Luisa AchaerandioPalabras #13definición de vida capítulo luisa achaerandiocapítulo de 16 páginas luisa achaerandiopágina 13 definición de vida…esa dualidad de la que estaba hablando yo justo en este momento y dice que hay un planteamiento antiindividualista de la asistencia al que hay que referirse y quería yo exactamente ir, porque claro aquí empieza ya a... Tal que no hay una definición entonces. Exactamente, pero no, pero él había planteado una; espera te haber sido, porque el capítulo son 16 páginas, si tú quieres introduce algo y te la doy en una frase. Vale, bueno, entonces lanzo otra pregunta diferente. Perdona, Luisa, en la página 13, al final, en el penúltimo párrafo, tienes la definición. Proponemos entender la vida como... Eso, tú ya lo has encontrado, ¿eh? Lo digo yo, si quieres. Espérate, espérate, espérate. Página 13 Ya estamos. Proponemos entender la vida como, exactamente, una red de interacciones e interdependencias que se establece…
Luisa Achaerandio y Héctor Socas discuten sobre la definición de autorreplicación en relación con la vida, señalando que incluso los organismos dependen de un entorno y una microbiota para sobrevivir.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #12autorreplicación y microbiotaviroides versus obeliscodefinición autorreplicable viroideentorno necesario para viroides…mental y concebir algo que podríamos estar de acuerdo en que es vida por ejemplo una especie sintética que nosotros podamos fabricar y que no se reproduce sino que simplemente la fabricamos en laboratorio y digo bueno estas cosas están vivas y también en Esa definición, lo de auto replicarse también hay que ver qué quiere decir porque auto implica que por ti mismo pero nosotros de hecho ni siquiera vivimos por nosotros mismos sin la microbiota, por ejemplo, que hablábamos, que necesitamos también todo un entorno para convivir no solo nosotros mismos. Precisamente lo de autorreplicable es lo que, o sea, al acercarnos, es lo guay a lo mejor que yo del obelisco, al acercarnos a una cosa tan pequeñita que casi escala o que está incluso un poco, o sea, lo suficientemente lejos del concepto de vida, ¿no? Lo que significa autorreplicable es justo la definición que diferencia un viroide de un obelisco que contiene la información dentro de sí mismo, es verdad que no lo puede hacer de manera independiente para, si está en el medio adecuado. Digamos que puedan surgir esas ribocimas que hacen que se pueda replicar y encima evolucionar y encima crear esas proteínas en el entorno y encima hacer algo que no sabemos, porque ahí hay unas proteínas que no sabemos qué están haciendo. O sea, que hay una…