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Haplotipos Humanos y paleogenómica
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Luisa Achaerandio discute un problema fundamental de la paleogenómica: la conservación incompleta del ADN antiguo, lo que limita las regiones comparables.
…repente tiene curiosidad y le gustaría a él escribir este correo ahora mismo. No, estaría muy bien y seguro que será receptivo y le encantará, ¿no? Ya cuando publiquemos el podcast le puedes hasta enviar el link. Pues sí, sí, sí, a mí me gustaría simplemente. Decir que la paleogenómica tiene un principal problema, que es que realmente tú cuando vas a coger una muestra de ADN antiguo no se conserva en su totalidad, con lo cual puedes comparar solo de ciertas regiones; ciertas regiones que estén más conservadas, que aparte tengan la característica de que estén conservadas evolutivamente, y luego supongo, pues no sé si lo has comentado o se comenta en el artículo, pero no sé si han cogido, como en el caso de los haplotipos humanos, ciertos; pues ciertas secuencias. No sé si van por ahí los tiros, pero realmente está más relacionado, creo yo, a cómo es la dispersión del gato que realmente saber una marca histórica de cuándo se produce esa domesticación que en algunos casos diría que desde luego en algunas especies de…
Significado #1 · Palabras #1
Francis Villatoro aclara que el estudio mencionado no es etológico sino paleogenómico, y se refiere a un análisis de la evolución genética antigua. Alberto Aparici confirma esta clasificación y bromea sobre ser presentado como experto en paleogenómica.
Habla: Francis VillatoroSignificado #4 · Palabras #3estudio paleogenómico de evolución genéticaignacio y estudios paleogenómicos anterioresluisa y ausencia de estudios paleogenómicosalberto experto en paleogenómicaalberto aparici experto paleogenómicapaleogenómica estudio aficionado expertoaficionado experto sin título…de África hace unos 2000 años, cuando otras teorías hablaban pues que podía haber venido de Egipto, de otros lugares y nos lo va a contar obviamente nuestro experto en etología animal. Claro, eso es, Alberto; yo soy el que más sabe aquí. Bueno, en realidad. Este no es un estudio etológico, es un estudio paleogenómico; es decir, se estudia la evolución y, en paleogenómica, pues ya no ha contado muchas veces muchos estudios. Alberto, también Ignacio ha contado alguno, como en el episodio anterior, y Luisa: no recuerdo que haya contado ningún estudio paleogenómico, pero lo mismo con el Herdía. De momento, no; de momento, no. Pero bueno, de etología sí que sé, puede ser el siguiente podcast de etología; sí que sé. Yo iba a decir, Alberto, que tienes razón, que es un estudio paleogenómico, así que Francis te presentará como experto en paleogenómica. Exacto, efectivamente, ya la todología. Rectifico y coloco a Alberto como experto en paleogenómica. Es lo que se llama el experto aficionado o el aficionado experto; no tiene título pero ha estudiado mucho. Bueno, yo no me voy a atribuir ningún tipo de conocimiento, pero me he leído este artículo y os lo puedo contar; digamos. A ver, este es un artículo peculiar y yo voy a señalar ahora cuando os lo cuente las cosas que me parecen curiosas. Mi sensación, sin yo saber nada de la intrahistoria de este artículo, habría que preguntarle a los autores, es que este artículo se empezó con…
Alberto Aparici explica la controversia sobre el origen del gato doméstico (Feliscatus), señalando que se debe a la falta de datos hasta ahora, con la publicación de un artículo que presenta paleogenomas de gatos europeos y anatolianos.
Habla: Alberto ApariciPalabras #9paleogenomas de gatos europeos y anatolianosfeliscatus origen controvertido del gato doméstico…es que inicialmente querían hacer otra cosa y que se dieron cuenta de que tenían esta otra y que, porque esto a veces pasa, o sea, uno va siguiendo una pista, va tirando de un hilo y termina en otra cosa. Entonces, contexto para entender todas estas cosas. El gato doméstico es una especie que científicamente se llama Feliscatus, ¿vale? Entonces el origen del gato doméstico ha sido un poco controvertido durante años y mi sensación es que lo ha sido por falta de datos, básicamente porque este artículo por primera vez presenta un montón de paleogenomas de gatos del continente europeo y de Anatolia que los presentan ellos por primera vez. Que uno tendría la sensación de que todos esos genomas deberían llevar tiempo en el mercado, digamos, como si los hay, por ejemplo, paleogenomas de perros y de lobos bastante antiguos y de muchos lugares del mundo. Pues de gatos parece que no eran tan abundantes. Entonces, las diversas especies de gatos, o las más cercanas entre los félidos al gato doméstico, en realidad son bastante, bastante cercanas. En Europa hay un gato salvaje, los ingleses le llaman wildcat, nosotros en español supongo que le llamaríamos gato…
Ignacio Crespo comenta sobre la trayectoria académica de Marco de Martino, el autor del artículo científico discutido anteriormente, y su especialización en paleogenómica de gatos.
Habla: Ignacio CrespoPalabras #12paleogenómica de gatos marco de martinoartículos scopus paleogenómica de gatospublicaciones paleogenómica gatos 2025…Después de mirar esto y ver que él se dedica mayormente a paleogenómica de gatos, porque en su mismo Twitter tiene además en la biografía un arroba a ERC Félix, que es investigación de las características que podrían explicar el éxito evolutivo de los gatos. Ahí hay una vinculación tremenda, he ido al Scopus y veo que en 2025 tiene 1, 2, 3, 4, 5, 6 artículos publicados todos sobre paleogenómica de gatos. Tiene sentido a priori que igual venga de ahí, de un trabajo gordo que ha hecho y que luego ha dividido resultados para distintas publicaciones. Es más, yo he querido ser, digamos, bondadoso y no Malpensar, digamos, pero ahora voy a malpensar, ¿vale? Ahora que ya os he explicado el artículo, como yo creo que hay que pensarlo porque hay que bien pensar, yo tengo que decir que me sorprende infinito que hasta en el abstract del artículo hablen de los…
Luisa Achaerandio discute un problema fundamental de la paleogenómica: la conservación incompleta del ADN antiguo, lo que limita las regiones comparables.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #1 · Palabras #1adn antiguo conservación incompletahaplotipos humanos y paleogenómicaregiones conservadas evolutivamente…repente tiene curiosidad y le gustaría a él escribir este correo ahora mismo. No, estaría muy bien y seguro que será receptivo y le encantará, ¿no? Ya cuando publiquemos el podcast le puedes hasta enviar el link. Pues sí, sí, sí, a mí me gustaría simplemente. Decir que la paleogenómica tiene un principal problema, que es que realmente tú cuando vas a coger una muestra de ADN antiguo no se conserva en su totalidad, con lo cual puedes comparar solo de ciertas regiones; ciertas regiones que estén más conservadas, que aparte tengan la característica de que estén conservadas evolutivamente, y luego supongo, pues no sé si lo has comentado o se comenta en el artículo, pero no sé si han cogido, como en el caso de los haplotipos humanos, ciertos; pues ciertas secuencias. No sé si van por ahí los tiros, pero realmente está más relacionado, creo yo, a cómo es la dispersión del gato que realmente saber una marca histórica de cuándo se produce esa domesticación que en algunos casos diría que desde luego en algunas especies de…
Alberto Aparici responde a una afirmación anterior sobre la domesticación felina, refiriéndose a un estudio que identifica haplotipos en Félix Libica y su relación con el gato doméstico moderno.
Habla: Alberto ApariciSignificado #17 · Palabras #2haplotipos en felix líbicagato doméstico moderno y haplotiposgenomas híbridos gato montes europeoruta de domesticación felina alternativa…no se ha producido. Es como que han evolucionado con nosotros, pero como evolucionan, como tú dices, los gorriones, no necesariamente como algo que nosotros hemos relacionado porque nosotros queremos, sino como que ellos han decidido realmente estar aquí. Pues a ver, te contesto, sí que dicen algo en ese sentido, ellos identifican varios haplotipos en Félix Líbica y uno de ellos es el que está más cerca del gato doméstico moderno y los otros lo que ven es que los genomas que hibridan con el gato montes europeo son de otros haplotipos y de ahí es de donde sacan, no vino por esta ruta, tuvo que venir por otra. Pero creo recordar que mencionan 3 o 4, ya sabes que con humanos se conocen, creo que son decenas, ¿no? Y todo esto. Y fíjate, por esto que has dicho, ellos dicen explícitamente: hemos generado 70 genomas antiguos de baja cobertura. Y tenemos también, a ver cuánto han dicho, y 17 de la actualidad y de museos, ¿vale? Que también son relativamente recientes y son de museos,…
Alberto Aparici se muestra inseguro sobre cómo responder a una pregunta estándar de genética relacionada con los haplotipos y sugiere que Luisa podría ofrecer una definición.
Habla: Francis VillatoroSignificado #3 · Palabras #11haplotipos y árboles filogenéticosvariantes genéticas definen linajesluisa define haplotipo genéticacélulas germinales y carga genéticahaplotipo y linaje maternalcromosomas diploides versus haploidesanálisis genético de luisa achaerandiohaplotipo del linaje femeninocromosoma i y pruebas…y que sí, que por ejemplo estamos hablando a nivel de limpieza de otros lugares, tendremos que cambiar de molécula y tendremos que cambiar de receptores, ¿vale? Eso en general. Perfecto, Alberto, para que nos cuentes algo, aprovechando que todavía estás. Con nosotros, no sé si serás capaz de contestar a esta pregunta: una pregunta estándar de genética pregunta, Will to Rain; no sé cómo lo querrá que lo pronuncie. Estaría bueno recordar lo que es un haplotipo, ¿te acuerdas o no? La verdad es que si lo tengo que definir de manera estricta la voy a liar seguro. Sé que es como unas ciertas variantes genéticas que definen linajes en un árbol filogenético, pero no sería capaz de decir nada más. No sé si Luis, a lo mejor, puede decirlo. A ver, las células pueden ser diploides o haploides. Básicamente cuando son células germinales es simplemente que tienen la mitad de la carga genética. Nosotros tenemos 46 cromosomas y cuando se dividen en células germinales tenemos 23. Entonces básicamente esa parte del linaje materno, por eso se le llama haplotipo porque estamos siguiendo el linaje maternal, igual que podemos hacer el haplotipo de la I Por ejemplo, yo me he hecho un análisis genético; yo quería saber qué es lo que yo portaba internamente y tú genéticamente solamente se me ve el haplotipo del linaje femenino. Evidentemente no aparece ningún haplotipo i; bueno, evidentemente no lo sé, yo no lo sabía, pero ya tengo pruebas, quiero decir. Claro, porque no tienes cromosoma i, mayormente. Exactamente, entonces pues básicamente ese es el concepto, las células. Son o diploides que tienen toda la carga, los 46 cromosomas a nivel humano, ¿vale? Humano, los gatos tienen otro número, las lechugas tienen otro número y los helechos tienen, pues yo creo que era como unos mil cromosomas; es una cosa muy loca en las plantas,…
Francis Villatoro explica que cada persona posee un haplotipo, que es una colección de variantes genéticas identificadas a través de secuenciaciones de genotipo amplio (GWAS). Se menciona que estas secuenciaciones suelen analizar alrededor de 8.5 millones de SNIPs.
Habla: Francis VillatoroSignificado #2 · Palabras #17variantes genéticas y diferencias individualesnucleótidos snip y variaciones genéticasdeleciones y adiciones de nucleótidoshaplotipos y derivas genéticashaplotipo y variantes genéticassecuenciación de genotipo amplio gwas8500000 snips en secuenciaciónvariantes identificadas en aprotipohaplotipos y virus como h1n1herencia bloqueada de mitocondriavariantes genéticas y derivas genéticasnomenclatura haplotipo h1n1…los gatos tienen otro número, las lechugas tienen otro número y los helechos tienen, pues yo creo que era como unos mil cromosomas; es una cosa muy loca en las plantas, es un número muy loco, muy loco. Si queréis mirarlo, eso es una fantasía, de verdad. Pero esa es la base: células somáticas, diploides; células germinales, haploides, con las que se pueden establecer estos haplotipos y estas derivas. Precisamente para buscar estas derivas genéticas, bueno, yo lo definiría de otra manera: ¿Qué nos hace diferentes a unos de otros? Porque tenemos los mismos genes. Lo que nos hace diferentes son las variantes genéticas; es decir, cambios en una única letra, un SNIP, un cambio de un único nucleótido, una delección, un borrado de alguna de esas letras, la adición, el añadido de alguna letra, hay muchas variantes que incluyen varios nucleótidos, etc. Todas estas variantes es lo que se llama el aprotipo, entonces cada persona tenemos un aprotipo que es un conjunto de variantes. En SNIP por ejemplo, quiero recordar que los números actuales son del orden de 8 millones y medio o así de los que están habitualmente cuando se hace un GWAS, una secuenciación de genotipo amplio, lo que se mira básicamente son esos SNIP y son de ese orden, del orden de 8 millones y medio de variantes que son las que se han habitualmente identificado y entonces te colocan en un aprotipo. Tú para esta variante la tienes o no la tienes y cuando en una variante, como hay cuatro letras que puedes poner en el ADN en un lugar, pues tienes una letra o tienes otra o tienes otra; tienes un nucleótido o tienes otro, entonces esto te identifica dentro de, digamos, de ese, entre comillas, haplotipo. Sí, pero eso tiene que estar dentro de una variante y como va en bloque, por eso se asocia a las derivas genéticas, porque tú solamente miras determinadas secuencias, por ejemplo, de la mitocondria y por eso dice: ah, pues es el haplotipo H1N1 o lo que sea. H1N1 es de los virus de la gripe. Exactamente, va salido el virus de la gripe, pero es H no sé cuánto, HV, quiero decir, tiene también una nomenclatura de ese tipo; entonces es básicamente lo que se hereda en bloque y en la i precisamente es que se hereda en bloque de hijos a padres a abuelos o sea, básicamente es una de las cosas que yo digo de broma en clase que es que los padres, o sea que los Hombres son todos iguales, es como una broma que se hace porque ese cromosoma ahí se hereda como en bloque de hijos a padres y demás, y es como que se hace muy igual. Claro, por aportar un elemento a esto que dices, los cromosomas en el momento de crear los…