Búsqueda · 23 momentos en 12 episodios
Luisa AchaerandioJuan Carlos GilGastón GiribetIgnacio CrespoFrancis VillatoroHéctor Socasavance iniciativa pública proyecto genomasecuenciación genes zonas sin repeticionesfragmentos información craig ventergenes y técnica de secuenciaciónIniciativa PúblicaCraig VenterProyecto Genoma Humanosiglo XXIFrancis VillatoroIgnacioNIH (Institutos Nacionales de la Salud)hospitales Carlos IIICraig Venter InstituteCelera GenomicsWaxonCollinsAemófilos InfluenzalesLuisa AchaerandioADN
Genes y técnica de secuenciación
Con
0:000:301:001:302:002:303:003:44
Francis Villatoro explica cómo Craig Venter se benefició de los avances publicados por la Iniciativa Pública del Proyecto Genoma Humano, aprovechando para colocar fragmentos de información y acelerar la secuenciación de genes.
…Famoso en este programa, por ejemplo, Carlos López Jotín. Son gente que estuvo en esa iniciativa, pero es que había que estar, no te quedaba otro remedio para hacer a alguien en los 90. Bien, pues la ventaja que tenía Craig Venter es que usando como, digamos, Esqueleto, como lo que estaba siendo publicado por la Iniciativa Pública él podía ir a colocar sus trocitos y entonces las zonas realmente interesantes que son los genes son zonas en las que no hay repeticiones y la técnica chocan rápidamente esta secuencia de los genes. ¿Pero dónde está este gen? Pues había que esperar a que la Iniciativa Pública encontrara parte de ese gen porque en el momento en el que encontrara parte del gen tú ya rápidamente colocabas tu gen en su sitio; eso desde el punto de vista de la Iniciativa Pública. fue digamos muy criticado había mucha gente diciendo es que este señor nos está pisando es que este señor si no existiéramos nosotros él no podría hacer nada y lo está haciendo gracias a nosotros entonces eso generó cierto resquemor y como ahí estaba metido…
Significado #1 · Palabras #2
Francis Villatoro continúa explicando el contexto del Proyecto Genoma Humano, comparándolo con la técnica más innovadora desarrollada por Craig Venter para secuenciar genomas.
Habla: Francis VillatoroSignificado #11proyecto genoma humano públicosecuenciación con técnica estándarsecuenciar hemophilus influenzae…decidió, digamos, poder empezar a, entre comillas, comercializar el secuenciar cosas. Pero claro, en los 90 había una gran iniciativa, que es una iniciativa de principios de los 90, que era el Proyecto Genoma Humano, que desde la gran institución, el NIH, los Institutos Nacionales de Salud en Estados Unidos, que es la gran institución que financia la investigación biomédica, en España serían el Instituto, ¿cómo se llama? Los hospitales Carlos III, bueno, Carlos III, no me acuerdo de las siglas exactas, me acabo de olvidar. Este proyecto genoma humano proponía a nivel público secuenciar todo el genoma humano pero utilizando una técnica estándar, que es una técnica mucho más conservadora en la que secuencias grandes trozos primero; intentas localizar muy bien un trozo en un cromosoma, saber muy bien dónde está ese trozo, un trozo relativamente grande y ahora intentas secuenciar el trozo grande, lo que requiere una enorme cantidad, me aclara Ignacio, que son los institutos de salud Carlos III y si me permites hago otra aclaración porque cuando estabais hablando de hemófilos influenzae no quería interrumpir en ese. Momento, pero Héctor ha dicho el de la gripe; ojo, eso es el virus de la influenza. Estamos hablando aquí, aquí estamos hablando de una bacteria: bacterias respiratorias, sí.…
Francis Villatoro explica cómo Craig Venter aprovechó su técnica de shotgun para secuenciación y creó Celera Genomics, una empresa con gran financiación para competir con el Proyecto Genoma Humano.
Habla: Francis VillatoroPalabras #16secuenciación de hemophilus influenzaeproyecto genoma humano waxon collinstécnicas lentas proyecto genoma humanogarantías secuenciación orden adecuadoshotgun de venter y celera genomicssecuenciación del genoma humano por celerajcvi y técnica shotgun de ventercelera genomics frente al proyecto genoma…como gripe, pero bacterial. Y ya está, solo aquí porque estoy estrenándome con interrupciones en el programa. Muchas gracias por la aclaración y los oyentes que perdonen la voz que tiene Ignacio, pero está un poco tocado. Luisa, ¿tú querías decir algo más? No, eso, lo mismo, lo mismo, que básicamente era eso, que era una gripe bacteriana. O sea, un tipo de infección respiratoria bacteriana de un microorganismo, microorganismo gran negativo que se llama Aemófilos Influenzales. El proyecto Genoma Humano era un proyecto garantizado; era un proyecto riguroso que inició el premio Nobel, Waxon, y que continuó Collins, su sucesor como director del proyecto Genoma Humano, y era saber muy bien dónde se encuentra un trozo que yo voy a secuenciar y después con técnicas extremadamente lentas y extremadamente bioquímicas, demasiado húmedas, demasiado de laboratorio, ir secuenciando poco a poco ese gran trozo. Partirlo en trozos grandes y secuenciar esos trozos y tener garantías siempre de que lo estás haciendo en el orden adecuado y que tienes una muy buena localización de ese trozo. Eso, bueno, era un proyecto que en principio era lento, fue avanzándose en las tecnologías de secuenciación y fue acelerándose y ya alrededor del año 2000 ya estaba a buen ritmo e incluso llegó a utilizar las técnicas de shotgun de perdigonazos de Venter y Venter vio que podía, en paralelo a lo que estaba haciendo con su empresa, su instituto JCVI, podía crear una empresa bien financiada, la creo muy tarde, Celera Genomics, es del 98, con muy buena financiación para utilizar su técnica de secuenciación, de shock gun, para secuenciar el genoma humano. y hacer una iniciativa privada en paralelo a la iniciativa pública y que quizás pudiera vencer a la iniciativa pública. ¿Qué problema tenía la técnica shotgun? Pues la técnica shotgun tiene el problema de que realmente no sabe lo que está secuenciando ni dónde está, ¿vale? Hay una enorme cantidad, por ejemplo, las zonas repetitivas. Tú como una zona repetitiva AT, AT, AT, AT,…
Francis Villatoro explica cómo Craig Venter se benefició de los avances publicados por la Iniciativa Pública del Proyecto Genoma Humano, aprovechando para colocar fragmentos de información y acelerar la secuenciación de genes.
Habla: Francis VillatoroSignificado #1 · Palabras #2avance iniciativa pública proyecto genomasecuenciación genes zonas sin repeticionesfragmentos información craig ventergenes y técnica de secuenciación…Famoso en este programa, por ejemplo, Carlos López Jotín. Son gente que estuvo en esa iniciativa, pero es que había que estar, no te quedaba otro remedio para hacer a alguien en los 90. Bien, pues la ventaja que tenía Craig Venter es que usando como, digamos, Esqueleto, como lo que estaba siendo publicado por la Iniciativa Pública él podía ir a colocar sus trocitos y entonces las zonas realmente interesantes que son los genes son zonas en las que no hay repeticiones y la técnica chocan rápidamente esta secuencia de los genes. ¿Pero dónde está este gen? Pues había que esperar a que la Iniciativa Pública encontrara parte de ese gen porque en el momento en el que encontrara parte del gen tú ya rápidamente colocabas tu gen en su sitio; eso desde el punto de vista de la Iniciativa Pública. fue digamos muy criticado había mucha gente diciendo es que este señor nos está pisando es que este señor si no existiéramos nosotros él no podría hacer nada y lo está haciendo gracias a nosotros entonces eso generó cierto resquemor y como ahí estaba metido…
Francis Villatoro explica cómo la complejidad del genoma humano superó las expectativas iniciales tras su secuenciación completa.
Habla: Francis VillatoroSignificado #8genoma humano superó expectativassecuenciación completa del genoma humanoproblema tras secuenciación humana…genes a principio pensó que eran 24.000 hoy día son unos 21.000 tenemos otras cosas los pseudogenes, pero además tenemos una enorme cantidad de estructuras que se heredan porque están en el ADN y que influyen en toda la regulación, en todos los mecanismos. Es decir, todo se convirtió extremadamente complicado. Cuando vimos el genoma completo vimos que este asunto era muy complicado y que lo que se esperaba era publicar el genoma humano completo y en pocos años, por les cinco años, por les diez años, íbamos a resolver el problema de las Enfermedades. Enfermedades de origen genético, pues lo que resulta 25 años más tarde es que todavía estamos en pañales y nos queda todavía muchas décadas de investigación para resolver ese problema. Entonces, pero claro, Collins y la gente de la iniciativa…
Francis Villatoro explica la dificultad de determinar los genes esenciales en bacterias sencillas, basándose en la técnica de apagar y encender genes.
Habla: Francis VillatoroPalabras #19genes esenciales en bacterias sencillastécnica de apagar y encender genes2 elevado a 500 opciones bacterianasuniverso tiene 10 a 80 átomos…era clave, entonces se dedicó a secuenciar las bacterias más sencillas y empezó a trabajar con esas bacterias y una vez que tenía controlado más o menos Esto también se pensaba que era muy fácil, ¿vale? Que iba a ser muy fácil determinar los genes esenciales. Básicamente se utilizaba la técnica que se utilizaba de toda la vida desde poco después del ADN, que es ir apagando y encendiendo genes. Claro, pensaban que una bacteria mínima tendría 200 genes. Resulta que no, que tiene del orden de 500; y apagar y encender, pues es una barbaridad: son 2 elevado a 500, eso son, no hay átomos en el universo para cada una de las opciones; el universo tiene 10 a 80 átomos, 2 elevado a 500 es una barbaridad, no os hago el cálculo para que no os asustéis. entonces un problema que parecía súper sencillo se convirtió tremendamente complicado y requería cada vez más inversión; y como requería cada vez más inversión decidió empezar a plantearse llamarle mucho la atención de los medios con pequeños hitos: vamos a…
Francis Villatoro afirma que la secuenciación del genoma humano fue un hito fundamental en biología al inicio del siglo XXI y considera que sentó las bases para la medicina personalizada.
Significado #6secuenciación del genoma humanomedicina personalizada siglo xxitratamiento de cánceres con secuenciaciónexpresión génica en células cancerosas…digo eso, para los que saben, ya saben por dónde van los tiros. Yo creo que puede ser un buen candidato a premio Nobel el año que viene y quizás el año siguiente. Ya si no se lo dan el año que viene y el siguiente, ya probablemente no se lo den nunca, ¿no? Algo absolutamente fue el inicio del siglo XXI en biología, o sea, el gran hito del siglo XXI en biología fue el protógeno humano, eso fuera de toda duda Y yo añadiría que además construimos la forma que entendemos el mundo sobre narrativas y esta es la narrativa fundacional de toda la medicina personalizada que con suerte se seguirá desarrollando durante este siglo y que será el gran avance de la medicina de este siglo, ya no como promesa lejana, sino como que estamos poco a poco aproximándonos ya en el presente, sobre todo en el tratamiento de algunos cánceres, que se puede hacer una secuenciación bastante interesante para ver cómo se expresan los genes en esas células, qué terapia específica, por ejemplo, cómo desensibles son a determinadas hormonas o a determinado fármaco, ahí se está avanzando muy bien. y sobre lo que decías hay dos cosas que quería apuntar, una la de Collins que por supuesto pasaré por encima y muy muy rápido pero sí quería apuntarlo y la otra sobre el malo que preguntaba Héctor de las opciones que has dado Francis yo estaba pensando…