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Sara RobiscoJuan Carlos GilHéctor SocasGastón Giribetmicromembranas atraen microorganismosquimiofector atrae bacterias robiscomovimiento hacia el quimiofactorbacterias con movilidad atraviesan membranamachine learning sencillo para bacteriasdetector de gotas clasifica microbiosclasificador binario reconoce formaspc chiquitito analiza microbiosmembranas para capturar microorganismosbacillus subtilis experimento reproducidopseudohalteromonas aloplantis selección membranasarquea aloferax volcani desafío experimentaciónbacillus subtilis en el sueloencapsulamiento de bacteria para sobrevivirtemperaturas hasta 100 grados bacillus subtilisexoesqueleto bacterial para funciones vitalesBacillus subtilisPseudohalteromonas aloplantisAloferax volcaniSara RobiscoMar MuertoP. aloplanktisMarteL-serinaAlloplanctisB. subtilisPealoplantisBactaibArkeaEreselinaH-VolcaniMachine LearningRyuguB subtilis
Experimento Sara Robisco bacterias arquea
Con
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Sara Robisco continúa explicando el proceso de experimentación, detallando que los investigadores han reproducido un experimento previo y se enfrentan a desafíos como la selección de membranas adecuadas para capturar microorganismos.
…Un detector de imágenes por Machine Learning muy potente que consumiría muchos recursos, entonces tendrías que tener un equipo muy pesado, muy potente y eso no es viable, entonces dice esta gente: vale, tenemos que crear algo para pillarlos, dice: oye, ¿Y si los pillamos quietecitos una vez que los atrapamos? ¿Cómo los atrapas? Pues esta es la cuestión: se les ha ocurrido un invento que consiste en dos cámaras separadas por unas micromembranas de tal forma de que tú pones tu trozo de sedimento en una parte de la cámara, en un lado de la membrana y en otro pones un elemento que lo vamos a llamar el quimiofector, que lo que provoca es que haya un movimiento hacia él. Las bacterias se sienten atraídos, los microbios se sienten atraídos hacia él de una forma salvaje. Entonces es fácil, ¿por qué? Porque solo aquellos seres que están vivos y tienen movilidad pueden atravesar la membrana y acabar en el quimiofactor. Es una aproximación barata y sobre todo es una idea. muy buena. Entonces, ¿qué necesitas para detectar esas bacterias? Un sistema de machine learning muy sencillo, un detector de gota, un detector de hay, no hay, además binario, un clasificador; entonces te reconoce los microbios, tenga la forma que tengan, siempre y cuando descubre estas formas, viene entrenado y no necesita una potencia de cálculo enorme, simplemente con un PC chiquitito te va el día. Entonces esa aproximación es muy buena, pero claro, como decimos, de dicho al hecho hay un trecho; entonces esta gente en su trabajo se lo pasaron muy bien. ¿Qué han hecho? Han reproducido el experimento porque además y han descubierto otro problema. Dice: vale, ¿qué membrana elegimos? ¿y con qué bacterias, con qué microbios practicamos? Pues los he hecho spoiler varias veces y han elegido tres bacterias: han cogido Bacillus subtilis, Pseudohalteromonas aloplantis y una arquea, dos bacterias y una arquea, la arquea Aloferax volcani. ¿Y ¿Por qué las han elegido? Pues es muy curioso, porque esta gente se ve que son biólogos, entonces han hecho un estudio de bacterias y arqueas y han descubierto que Bacillus subtilis es un bacilo que se encuentra en todo el suelo repartido por toda la tierra. Tiene una capacidad que es muy buena y es que resiste temperaturas hasta 100 grados porque una capacidad que tienen algunas bacterias, no todas, es que se encapsulan, que es el encapsulamiento; el encapsulamiento de una bacteria es que su membrana la ponen en condiciones desfavorables, mucho frío, mucho calor, para evitar desecarse y morir. Su bacteria vuelve muy dura, muy dura, muy dura, se apelotonan, ¿vale? Entonces se forma como un exoesqueleto y así pueden estar mucho tiempo, haciendo las funciones vitales mínimas, mínimas, mínimas y así no morir. Y cuando ya las condiciones ambientales vuelven a ser buenas, se desencapsulan y ya pueden hacer su ciclo vital otra vez perfectamente. Eso hace la tuberculosis, por ejemplo, que es una bacteria muy común, sobre todo en Europa y África, en Norteamérica no…
Significado #2 · Palabras #1
Sara Robisco continúa explicando cómo observar microorganismos en muestras de agua, describiendo la apariencia de las partículas y los microbios que se ven a través de una placa.
Habla: Sara RobiscoSignificado #3experimento interactivo sara robiscomicrobios al microscopio casamuestra agua dudosa procedenciajuego oyentes redes socialesmicroorganismos en muestras de aguapartículas en suspensión placamovimiento rápido microbios agua…en nuestro caso, a Marte, ¿qué buscamos? Pues eso, las huellas de posible vida o posibles restos de vida; estamos buscando en un contorno geológico, ¿no? Revisamos la geología de la zona buscando biomarcadores y dice allí: ¿y por qué no buscamos microbios? Entonces a uno de ellos se le ocurrió: ¿y si buscamos microbios? Y dijeron: vale, ¿y los microbios qué característica tienen? Dice: pues yo cuando miras un microbio al microscopio, aquí quiero que todos los oyentes cierren un poco los ojos y se acuerden; vosotros si tenéis un microscopio en casa y si no estáis tardando. Cuando coges una gota de agua de dudosa procedencia, cualquiera para investigar, ¿qué podemos hacer una cosa, un juego con los oyentes? Podéis contarnos en redes sociales de dónde habéis cogido muestras. ¿Y qué habéis visto? Bueno, pues cuando cogemos esas gotas de agua, las ponemos en la placa y observamos los microbios, pues tenemos varias cosas: partículas en suspensión y los microbios, ¿no? ¿Y qué pasa con los microbios? Que todos vemos que cruzan como súper rápido, y luego otro por ahí, van como locos, ¿no? Entonces claro se les ocurrió porque esto tiene un problema. Esa velocidad y es que si tú tomas una muestra en el espacio para estar detectando estos seres vivos a esa velocidad que se mueven, necesitarías una capturadora de imagen muy, muy rápida que sea capaz de pillarlos en ese momento. Un detector de imágenes por…
Sara Robisco continúa explicando el proceso de experimentación, detallando que los investigadores han reproducido un experimento previo y se enfrentan a desafíos como la selección de membranas adecuadas para capturar microorganismos.
Habla: Sara RobiscoSignificado #2 · Palabras #1micromembranas atraen microorganismosquimiofector atrae bacterias robiscomovimiento hacia el quimiofactorbacterias con movilidad atraviesan membranamachine learning sencillo para bacteriasdetector de gotas clasifica microbiosclasificador binario reconoce formaspc chiquitito analiza microbiosmembranas para capturar microorganismosbacillus subtilis experimento reproducidopseudohalteromonas aloplantis selección membranasarquea aloferax volcani desafío experimentaciónbacillus subtilis en el sueloencapsulamiento de bacteria para sobrevivirtemperaturas hasta 100 grados bacillus subtilisexoesqueleto bacterial para funciones vitales…Un detector de imágenes por Machine Learning muy potente que consumiría muchos recursos, entonces tendrías que tener un equipo muy pesado, muy potente y eso no es viable, entonces dice esta gente: vale, tenemos que crear algo para pillarlos, dice: oye, ¿Y si los pillamos quietecitos una vez que los atrapamos? ¿Cómo los atrapas? Pues esta es la cuestión: se les ha ocurrido un invento que consiste en dos cámaras separadas por unas micromembranas de tal forma de que tú pones tu trozo de sedimento en una parte de la cámara, en un lado de la membrana y en otro pones un elemento que lo vamos a llamar el quimiofector, que lo que provoca es que haya un movimiento hacia él. Las bacterias se sienten atraídos, los microbios se sienten atraídos hacia él de una forma salvaje. Entonces es fácil, ¿por qué? Porque solo aquellos seres que están vivos y tienen movilidad pueden atravesar la membrana y acabar en el quimiofactor. Es una aproximación barata y sobre todo es una idea. muy buena. Entonces, ¿qué necesitas para detectar esas bacterias? Un sistema de machine learning muy sencillo, un detector de gota, un detector de hay, no hay, además binario, un clasificador; entonces te reconoce los microbios, tenga la forma que tengan, siempre y cuando descubre estas formas, viene entrenado y no necesita una potencia de cálculo enorme, simplemente con un PC chiquitito te va el día. Entonces esa aproximación es muy buena, pero claro, como decimos, de dicho al hecho hay un trecho; entonces esta gente en su trabajo se lo pasaron muy bien. ¿Qué han hecho? Han reproducido el experimento porque además y han descubierto otro problema. Dice: vale, ¿qué membrana elegimos? ¿y con qué bacterias, con qué microbios practicamos? Pues los he hecho spoiler varias veces y han elegido tres bacterias: han cogido Bacillus subtilis, Pseudohalteromonas aloplantis y una arquea, dos bacterias y una arquea, la arquea Aloferax volcani. ¿Y ¿Por qué las han elegido? Pues es muy curioso, porque esta gente se ve que son biólogos, entonces han hecho un estudio de bacterias y arqueas y han descubierto que Bacillus subtilis es un bacilo que se encuentra en todo el suelo repartido por toda la tierra. Tiene una capacidad que es muy buena y es que resiste temperaturas hasta 100 grados porque una capacidad que tienen algunas bacterias, no todas, es que se encapsulan, que es el encapsulamiento; el encapsulamiento de una bacteria es que su membrana la ponen en condiciones desfavorables, mucho frío, mucho calor, para evitar desecarse y morir. Su bacteria vuelve muy dura, muy dura, muy dura, se apelotonan, ¿vale? Entonces se forma como un exoesqueleto y así pueden estar mucho tiempo, haciendo las funciones vitales mínimas, mínimas, mínimas y así no morir. Y cuando ya las condiciones ambientales vuelven a ser buenas, se desencapsulan y ya pueden hacer su ciclo vital otra vez perfectamente. Eso hace la tuberculosis, por ejemplo, que es una bacteria muy común, sobre todo en Europa y África, en Norteamérica no…
Sara Robisco describe las características de *Aloferax volcani*, una Arkea ampliamente estudiada y su importancia para astrobiólogos y biotecnólogos debido a sus aplicaciones enzimáticas.
Habla: Sara RobiscoPalabras #3bacteria p aloplanktis aguas antárticastemperaturas bajas superficie arcianaresistencia temperaturas entre menos 2 y 29 gradosbacteria aeróbico tipoarquea aloferax volcani forma variableaplicaciones enzimáticas aloferax volcanihábitat salino arquea mar muerto…si me he perdido algo; el herpes es un virus, ¿no? El herpes es un virus, ahí lo estoy mezclando, no sé qué forma. No, no, pero esa es de la varicela, es el mismo, que se te queda la bacteria, pero bueno, es que hay virus que se te pueden quedar ahí. Bueno. vamos con nuestra segunda bacteria, P. aloplanktis, ¿vale? Esta bacteria la han elegido porque está presente en aguas antárticas entonces es muy resistente a temperaturas bajas, entonces claro dicen en una superficie arciana pues tenemos temperaturas muy bajas, pues esta es la que en temperaturas más bajas resiste, vamos a probar con ella porque en Marte de haber algo sería parecido, venga, entonces es capaz de resistir temperaturas entre menos 2 grados y medio y 29 grados que no puede no parecer mucho pero para una bacteria es mucho y es de tipo aeróbico, la otra era anaeróbica y vamos a por nuestra Arkea H. Volcani, es una de las Arkeas más estudiadas globalmente, si no la más; o sea, es una cosa tremenda. Es su forma, esta plantea problemas porque cambia de forma; es muy divertida. Puede tener diferentes tipos de formas y tal. La Arquea es como más plástica que la bacteria, en este caso estas dos que hablamos tienen una forma alargadita, una es un vacilo, su forma de bastón y la otra es alargadita. Entonces, tiene mucho interés por astrobiólogos y biotecnólogos debido a sus aplicaciones enzimáticas. Su hábitat natural es muy salino; es la arquea que vive en el mar muerto, para que os hagáis una idea. Vive en zonas donde otros no toleran vivir, entonces esto es bastante interesante. La motilidad de este bicho es un poco curioso porque tiene como dos fases; en sus fases primarias es muy móvil, ella se transporta y tal y luego llega un momento en su crecimiento que se queda quieta y ya no se mueve, entonces tiene sus cosas que le hacen…
Sara Robisco explica la elección de L-serina como atrayente para las bacterias *Aloferax volcani*, destacando su presencia en muestras de Ryugu y su potencial existencia en Marte.
Habla: Sara RobiscoSignificado #19l-serina atrayente bacterias aloferaxeserina en muestras ryugucondrita carbonácea sistema solarposible presencia eserina marte…en sus fases primarias es muy móvil, ella se transporta y tal y luego llega un momento en su crecimiento que se queda quieta y ya no se mueve, entonces tiene sus cosas que le hacen interesante para este estudio. La verdad es que las tres son muy buenas. ¿Y qué usan para atraerlas? ¿Qué quimiofectores estamos usando? Pues se usa la L-serina. ¿Por qué han escogido la L-serina? Porque la L-serina, aparte de ser un quimiofector que atrae a muchísimos microorganismos de la Tierra, es uno de, es un, a ver como lo digo, se ha encontrado el eserina en Ryugu, en las muestras de Ryugu había el eserina entonces es muy interesante por esto, porque al estar en una condreta carbonácea muy prístina se cree que este aminoácido pudo estar presente incluso antes de que nuestro sistema solar se generase. Entonces es interesante que respondan a esto porque ya tienes algo que puede estar presente en Marte ya que las condritas carbonáceas impactaron contra la Tierra, impactaron contra Marte. Entonces, es posible que aquí tenemos el eserina, pero que allí en Marte o en otros cuerpos del Sistema Solar haya el eserina. Entonces, no han hecho, como diríamos nosotros, no han dado puntada sin hilo. Hay que recordar que cuando buscamos microorganismos en Marte, o sea, todavía no hemos llevado un buen laboratorio de análisis que nos dé una buena, una respuesta definitiva y hubo bastante polémica con las ondas Viking que creo que fueron las últimas en…
Sara Robisco explica la incertidumbre existente sobre el porcentaje de bacterias con movilidad, basándose en datos de una base de datos llamada Bactaib.
Habla: Sara RobiscoSignificado #16 · Palabras #10prokaryotas con motilidadbactaib base de datos bacteriasflagelos cilios bacterias moviles80 bacterias descritas moviblesbacterias movilidad porcentaje bactaibprokaryotas motilidad rango incertidumbrebiomarcadores estudio bacterias motilidad…no hemos llevado grandes experimentos astrobiológicos a Marte, pero los tenemos. Están en un hangar, se llama Rosalind Franklin, y está esperando que algún día huele. Está esperando la pobre ahí que no veas y sobre lo que has dicho de que la motilidad es muy presente pues fíjate hay una falta de consenso sobre eso hay una falta de consenso sobre el porcentaje de prokaryotas con motilidad debido a muchos estudios se han hecho un montón y en los años a finales de los 90 mediados 96 se pensaba que un 80% de las bacterias descritas eran movibles mediante flagelos, cilios, estos sistemas que tienen las bacterias para moverse. Pero claro, dices, oye, un 80% es la mayor parte. Pues no, amigos. Usando bancos de cepas de datos de bacterias, hay una base de datos llamada Bactaib, muy interesante, que tiene 14.309 cepas diferentes de bacterias. Se ha descubierto que solo un 40% de estas bacterias tienen movilidad. De todas formas se sigue estudiando. Para que os hagáis una idea de la incertidumbre que hay de esto, se cree que hay un rango de bacterias con motilidad, vamos, prokaryotas con motilidad, perdón, entre un 5 y un 80%. Es ese rango enorme con el que jugamos, porque claro, hay tanto por conocer. De todas formas, para esta historia de los biomarcadores, de buscar biomarcadores, en este caso solemos hablar de biomarcadores en atmósferas de exoplanetas y tal pero también biomarcadores también es buscar microorganismos en Marte, por supuesto En este contexto realmente es que te da un poco igual porque tú vas a…
Sara Robisco describe los resultados de un experimento realizado con bacterias y una arquea, donde se observó un aumento significativo en la población entre un 300% y un 400% tras la aplicación de ciertas concentraciones.
Habla: Sara RobiscoSignificado #1 · Palabras #2bacterias marcianas medidas desconocidasmembrana semiperneable grosores distintossuelo marciano centrifugado muestras flotantesquimiofector comidita para bacteriaspealoplantis control en estudioquimiofector repulsión pealoplantisestudios previos repelencia pealoplantispealoplantis detecta vida en martequimiofector reacción membrana pealoplantisalloplanctis cinco seis horasb subtilis muchas horasmicroorganismos individuales martefotografías hora tres horas bacteriasclasificador 5 o 500 machine learningentrenamiento sistema sencillito ordenador casamachine learning detección vida martequimiofector comparado con algasmedio cultivo estándar bacteriascultivo de agar como controlarquea coloniza con concentracionesbacterias aumentan población 300-400experimento sara robisco bacterias arqueareacción microorganismos l-serina marterepulsión concentración minimoles l-serinaatracción mayor concentración l-serinapaper resiliencia experimento vidaarquea atraída por ereselinah-volcani coloniza l-serinaexperimento vida en marte sara robisco…ahí sería que fuera el 0%, o sea, que realmente la vida en Marte hubiera sido tal que toda ella absolutamente se queda quieta para la foto O que esté extinta, que hubiese estado y que ya está Claro, que eso también, este experimento ayudaría un poco, ¿no? Pero vamos al experimento porque parece que da un poquito de margen de confusión, ¿no? Porque realmente ellos no fotografían imágenes en movimiento esta semimembrana semiperneable que ponen en medio tienen varias han probado con distintos tipos de grosores porque claro no conocemos es muy divertido no conocemos las bacterias que puede haber en Marte no conocemos sus medidas entonces claro ponen los dos medios a tierra el suelo lo sacuden mucho lo menean centrifugan y oponen las bacterias toman muestras de lo que flota y lo van depositando en una membrana de las cámaras y aquello que se pasa a través de la membrana al quimiofector se queda quieto. ¿Por qué? Porque ya tiene comidita. Y una cosa que no he dicho, la segunda bacteria que he descrito, Pealoplantis, se empezó poniendo en el estudio como control porque no se siente atraída por este quimiofector. al contrario, los estudios hasta ahora demostraban que le repelía, entonces dijeron vamos a ponerla porque le arrepele, vamos a ver qué pasa Bueno, pues ¿qué pasa? Que cuando atraviesan la membrana y se van al quimiofector se quedan quietas. Dicen: esto es para mí, esto es para mí; pues ya me quedo quietecita, ya no me muevo más, y ese es el momento de hacer una única foto que puede ser una a la hora y otras tres horas porque se ha estudiado que estas bacterias a partir de cinco o seis horas en el caso de Alloplanctis y me parece que muchas más horas en B. subtilis empiezan ya a crear. Colonias y no les interesa esas colonias y les quieren ver el microorganismo que ha llegado. Entonces, según se posan a la hora, hay una primera foto a cabo de una hora y otra a las tres horas y detectas las bacterias, los elementos que hay y los cuentas. ¿Por qué? Porque están quietos, con una única foto ya tienes un detector que te dice hay o no hay o si quieres complicar un poquito pero tampoco necesitas potencia de cálculo cuenta esos puntitos y te devuelve tu clasificador 5 o 500 o lo que sea, entonces está muy bien porque el tiempo de computación y el tiempo de entrenamiento este sistema de Machine Learning es muy sencillito, necesitas muy poquitos recursos y muy poquito tiempo. En un ordenador normal de casa se podría incluso entrenar. Hasta aquí todo bien. Pero, ¿qué pasa? Hemos dicho que han encontrado. Pues mira, han probado con concentraciones de quimiofector y con un medio normal, el típico de la placa del alga. ¿Cómo se llama el alga que ponemos en las placas redondas? Bueno, el típico medio que ponemos en las placas de cultivo de bacterias. El cultivo de agar es el medio que han cogido como medio control y luego los medios con el eserina. Bueno, pues han hecho el experimento y efectivamente con las concentraciones que ellos ponen, tanto las dos bacterias como la arquea colonizan, vamos, colonizan, se posan y aumentan entre un 300-400% la población que hay. Claro, de no tener nada a tener un montón, o sea, es ese aumento de población. ¿Qué pasa? ¿Qué dice Sara? Pero una de ellas se sentía repelida, ¿qué ha pasado? Pues que los estudios demostraban que se sentía repelida con una concentración de menos minimoles de L-serina, pero se han dado cuenta de que a mayor concentración sí que se siente atraída. Y esto es interesante porque es la primera vez que se ha demostrado y es una cosa pues que ha salido por resiliencia en el propio paper. Otra cosa que nadie sabía es que la Arkea no se había visto que se sentía atraída por la Ereselina ni se había medido y se ha visto que sí, y la atracción es bastante tremenda. H-Volcani coloniza muy bien, invade muy bien la L-Serina. El experimento es muy completo y la verdad es que es muy prometedor porque estas cosas están curiosas; cosas que he visto porque tiene problemas. ¿Qué problemas tiene? Pues a la hora de hacer los análisis de datos, aquí son, porque son bastante sinceros, ellos son biólogos. Entonces, ¿qué han hecho? El análisis de datos, los recuentos que han hecho y tal, lo han hecho con Microsoft Excel. Y dices, tío,…
