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Luisa AchaerandioIsabel CorderoJuan Carlos GilIgnacio CrespoFrancis VillatoroHéctor SocasGastón Giribetalpha go y sus derivadosredes neuronales busca avanzadaaprendizaje automático problemas científicosespacios combinatoriales gigantescosproteínas piezas fundamentales de la vidaenzimas catalizan reacciones bioquímicasfactores de regulación controlan actividad celularproteínas forman andamiaje de las célulasJuan Carlos GilAlphaGoHéctor SocasGastón GiribetAlphaFoldIgnacio Crespo
Espacios combinatoriales gigantescos
Con
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Juan Carlos Gil reflexiona sobre el impacto de AlphaGo y sus derivados, destacando cómo una combinación de técnicas permite abordar problemas científicos con un gran número de posibilidades.
…decías la semana pasada, y yo creo que el asunto Go, el asunto juego, con Alberto y con María, pues se lo cubrimos muy bien, pero quizá nos quedamos un poquito cortos. Bueno, a mí lo que me particularmente es el impacto que ha tenido Alfago y sus nietos, ¿no? En mi opinión, de cómo una combinación de técnicas, ya lo mencionábamos, redes neuronales, busca avanzada y aprendizaje automático, pues podía navegar espacios combinatoriales gigantescos que a la postre aparecen en muchísimos problemas científicos en los que a veces entendemos las reglas del problema, pero son intratables o muy lentos de investigar, pues porque el número de posibilidades es enormísimo, ¿no? y uno de esos problemas combinatorialmente intratables es el famoso plegamiento de proteínas. Muy rápido, sí, las proteínas son las piezas fundamentales de la vida. Antes hablábamos de ácidos nucleicos que son los que llevan el mensaje para cómo codificar las proteínas, porque son estas que hacen prácticamente de todo en la vida. Las enzimas, un tipo de proteínas, catalizan reacciones bioquímicas; los factores de regulación controlan actividad celular. Hay otras proteínas que forman la estructura, el andamiaje de las células, otras que transportan moléculas, en fin, hacen de todo. Y sin embargo, químicamente una proteína es una cosita muy sencilla, no es más una cadena de pequeños componentes. Antes hablamos de las bases nitrogenadas, aquellos son los componentes de los ácidos nucleicos. Pero aquí son aminoácidos y nada, hay apenas en la vida unos 20 distintos. Pero lo interesante es que la función para lo que sirve, acaba sirviendo al cuerpo, a la vida; una proteína no viene dada directamente por esta secuencia de aminoácidos sino cómo esta…
Significado #1 · Palabras #1
Juan Carlos Gil reflexiona sobre el impacto de AlphaGo y sus derivados, destacando cómo una combinación de técnicas permite abordar problemas científicos con un gran número de posibilidades.
Habla: Juan Carlos GilSignificado #1 · Palabras #1alpha go y sus derivadosredes neuronales busca avanzadaaprendizaje automático problemas científicosespacios combinatoriales gigantescosproteínas piezas fundamentales de la vidaenzimas catalizan reacciones bioquímicasfactores de regulación controlan actividad celularproteínas forman andamiaje de las células…decías la semana pasada, y yo creo que el asunto Go, el asunto juego, con Alberto y con María, pues se lo cubrimos muy bien, pero quizá nos quedamos un poquito cortos. Bueno, a mí lo que me particularmente es el impacto que ha tenido Alfago y sus nietos, ¿no? En mi opinión, de cómo una combinación de técnicas, ya lo mencionábamos, redes neuronales, busca avanzada y aprendizaje automático, pues podía navegar espacios combinatoriales gigantescos que a la postre aparecen en muchísimos problemas científicos en los que a veces entendemos las reglas del problema, pero son intratables o muy lentos de investigar, pues porque el número de posibilidades es enormísimo, ¿no? y uno de esos problemas combinatorialmente intratables es el famoso plegamiento de proteínas. Muy rápido, sí, las proteínas son las piezas fundamentales de la vida. Antes hablábamos de ácidos nucleicos que son los que llevan el mensaje para cómo codificar las proteínas, porque son estas que hacen prácticamente de todo en la vida. Las enzimas, un tipo de proteínas, catalizan reacciones bioquímicas; los factores de regulación controlan actividad celular. Hay otras proteínas que forman la estructura, el andamiaje de las células, otras que transportan moléculas, en fin, hacen de todo. Y sin embargo, químicamente una proteína es una cosita muy sencilla, no es más una cadena de pequeños componentes. Antes hablamos de las bases nitrogenadas, aquellos son los componentes de los ácidos nucleicos. Pero aquí son aminoácidos y nada, hay apenas en la vida unos 20 distintos. Pero lo interesante es que la función para lo que sirve, acaba sirviendo al cuerpo, a la vida; una proteína no viene dada directamente por esta secuencia de aminoácidos sino cómo esta…
Juan Carlos Gil explica que AlphaFold no resolvió el problema del plegamiento de proteínas gracias a un profundo conocimiento de la química, aunque bromea sobre el conocimiento químico de Héctor Socas y Gastón Giribet.
Habla: Juan Carlos GilPalabras #5alphafold aprende patrones de proteínasalfago navega tablero 19 por 19…o sea, no estamos hablando de un problema académico Eso decía, que es que la función de todas las proteínas, que a la postre es una fracción brutal de la bioquímica de la vida depende de esta forma concreta tridimensional. Claro que tiene un impacto tremendo. Y no es que Alfafol consiguiese eso sabiendo mucha química, ¿vale? Estoy convencido que Héctor y Gastón, lo digo bromeando porque siempre decís lo de la química, saben más química seguramente que Alfafol, pero el bicho... Ya te digo yo que yo no Pero el bicho este es capaz de entender y de aprender patrones y de esta forma navegar el gigantesco espacio de posibilidades de la forma en la que se puede plegar una proteína de forma no tan diferente a como Alfago navegaba el tablero este de 19 por 19 casillas pero no todos los problemas en ciencia son iguales. AlphaFold funciona en un entorno relativamente sencillo porque tenemos la secuencia completa de los aminoácidos y además tenemos una base de datos de estructuras previamente resueltas contra las que podíamos validar el trabajo de AlphaFold. En ese sentido, es…
Ignacio Crespo reflexiona sobre cómo algunos investigadores atribuyen la conciencia a sistemas que maximizan la complejidad en un espacio reducido, relacionándolo con una porción significativa de la estructura cerebral.
Habla: Ignacio CrespoSignificado #9conciencia y sistemas complejosestructura cerebral y complejidadinvestigadores atribuyen conciencia a sistemasmaximiza complejidad en espacio reducido…propiedad emergente o como queramos aproximarlo y ellos se refieren a los granos espaciotemporales, a que si tú tienes un sistema compuesto de menores sistemas, puede ser perfectamente el universo, ¿cuál es el sistema cuya estructura causa efecto en relación A su tamaño tiene un mayor valor, una mayor complejidad en ese aspecto? Y ellos atribuyen la conciencia a ese sistema que maximiza la complejidad en un mínimo espacio. Lo relacionarían entonces con, tal vez no toda la estructura cerebral, pero una buena parte de la misma. Entonces ellos consideran que si se descubriera que una estructura Dentro del cerebro que no maximiza esta relación tiene propiedades conscientes, ¿se podría falsear su planteamiento? Entonces, lo que sí que es bueno es que, a pesar de tener una base idealista, porque es indiscutible, es falsable. Y por eso se suele…