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Luisa AchaerandioFrancis VillatoroHéctor SocasBorja TosarGastón Giribetcolaboración investigadores barcelona supercomputing centercomputación grande para resolver estructuras molecularesestructuras moleculares según artículo científicoLuisa AchaerandioBarcelona Supercomputing CenterAlfaFol
Computación grande para resolver estructuras moleculares
Con
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Luisa Achaerandio explica la importancia de la colaboración entre investigadores y centros de computación de alto rendimiento, como el Barcelona Supercomputing Center, para llevar a cabo estudios científicos complejos.
…Supercomputing Center, 314.000 billones de cálculos por segundo. 314.000 billones de cálculos por segundo. Lo vuelvo a decir porque es impresionante. O sea, de hecho ellos se ponen, digamos, la etiqueta de que van acelerando la ciencia, ¿no? Básicamente. Entonces, esto es fundamental que haya esta colaboración porque este estudio requiere no solo de las pruebas de laboratorio sino que también necesita una computación muy grande para poder llegar a resolver tanto determinadas estructuras que nos hace falta reconocer como dónde colocar otras estructuras moleculares para que realmente lo que nos está contando el artículo pueda llegar a funcionar. Entonces, volviendo a nuestra querida E. coli, se puede decir Escherichia coli y Escherichia coli; ambas dos se puede decir, pero por acortar es mejor decir E. coli. Es una conocida del laboratorio, mi alumnado, vamos, lo hemos utilizado muchísimo en clase;…
Significado #1 · Palabras #1
Luisa Achaerandio explica la importancia de la colaboración entre investigadores y centros de computación de alto rendimiento, como el Barcelona Supercomputing Center, para llevar a cabo estudios científicos complejos.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #1 · Palabras #1colaboración investigadores barcelona supercomputing centercomputación grande para resolver estructuras molecularesestructuras moleculares según artículo científico…Supercomputing Center, 314.000 billones de cálculos por segundo. 314.000 billones de cálculos por segundo. Lo vuelvo a decir porque es impresionante. O sea, de hecho ellos se ponen, digamos, la etiqueta de que van acelerando la ciencia, ¿no? Básicamente. Entonces, esto es fundamental que haya esta colaboración porque este estudio requiere no solo de las pruebas de laboratorio sino que también necesita una computación muy grande para poder llegar a resolver tanto determinadas estructuras que nos hace falta reconocer como dónde colocar otras estructuras moleculares para que realmente lo que nos está contando el artículo pueda llegar a funcionar. Entonces, volviendo a nuestra querida E. coli, se puede decir Escherichia coli y Escherichia coli; ambas dos se puede decir, pero por acortar es mejor decir E. coli. Es una conocida del laboratorio, mi alumnado, vamos, lo hemos utilizado muchísimo en clase;…
Luisa Achaerandio explica que las bacterias también necesitan aminoácidos debido a su ubicación, forma y sitios de unión, y cómo la bioinformática permite resolver estructuras.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #5 · Palabras #20aminoácidos en bacterias ubicaciónbioinformática resuelve estructuras bacterianassitios de unión bacteriasestructura proteica alfa folinteligencia artificial estructura proteicaparámetros estructura final inteligencia artificialmodelar estructura predecir proteína…Entonces justamente por ser así, esta proteína y la siguiente que sirve para transportar determinados alimentos, en concreto determinados compuestos de azufre hacia la célula, ¿para qué queremos el azufre? El azufre lo necesitamos para formar aminoácidos. También las bacterias necesitan aminoácidos, precisamente por el lugar en el que están, por la forma en la que tienen y por el tipo de sitio de unión que tienen. Gracias a la bioinformática, partiendo de esa idea de que tiene que tener algo parecido, se encuentra, se resuelve la estructura y es muy importante diferenciar una cosa en bioinformática, que no es. Lo mismo modelar una estructura que predecir. Predecir una estructura proteica es a raíz de unas determinadas parámetros que tú quieras, digamos, que cumpla esa estructura final utilizando una inteligencia artificial o inteligencia artificial con un programa informático; en concreto se puede utilizar AlfaFol. Tú puedes predecir una estructura, eso es predecir, pero en el momento en el que haces esto que han hecho estos autores, todos estos autores, que es añadirle en un lugar concreto una cosa muy concreta que te voy a contar, ¿vale? Que se llama triada catalítica. Esto significa ya modelar, es decir, ya estamos pasándonos el juego un poquito; estamos utilizando todas las posibilidades de nuestro entorno que todavía no te las he contado todas porque todavía te faltan datos para entender…