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Sara RobiscoJuan Carlos GilHéctor SocasGastón Giribetmembranas para capturar microorganismosbacillus subtilis experimento reproducidopseudohalteromonas aloplantis selección membranasarquea aloferax volcani desafío experimentaciónbacillus subtilis en el sueloencapsulamiento de bacteria para sobrevivirtemperaturas hasta 100 grados bacillus subtilisexoesqueleto bacterial para funciones vitalesBacillus subtilisPseudohalteromonas aloplantisAloferax volcaniSara RobiscoAlloplanctisB. subtilisPealoplantisFigura 3Juan Carlos GilMachine Learning
Bacillus subtilis experimento reproducido
Con
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Sara Robisco continúa explicando el proceso de experimentación, detallando que los investigadores han reproducido un experimento previo y se enfrentan a desafíos como la selección de membranas adecuadas para capturar microorganismos.
…una potencia de cálculo enorme, simplemente con un PC chiquitito te va el día. Entonces esa aproximación es muy buena, pero claro, como decimos, de dicho al hecho hay un trecho; entonces esta gente en su trabajo se lo pasaron muy bien. ¿Qué han hecho? Han reproducido el experimento porque además y han descubierto otro problema. Dice: vale, ¿qué membrana elegimos? ¿y con qué bacterias, con qué microbios practicamos? Pues los he hecho spoiler varias veces y han elegido tres bacterias: han cogido Bacillus subtilis, Pseudohalteromonas aloplantis y una arquea, dos bacterias y una arquea, la arquea Aloferax volcani. ¿Y ¿Por qué las han elegido? Pues es muy curioso, porque esta gente se ve que son biólogos, entonces han hecho un estudio de bacterias y arqueas y han descubierto que Bacillus subtilis es un bacilo que se encuentra en todo el suelo repartido por toda la tierra. Tiene una capacidad que es muy buena y es que resiste temperaturas hasta 100 grados porque una capacidad que tienen algunas bacterias, no todas, es que se encapsulan, que es el encapsulamiento; el encapsulamiento de una bacteria es que su membrana la ponen en condiciones desfavorables, mucho frío, mucho calor, para evitar desecarse y morir. Su bacteria vuelve muy dura, muy dura, muy dura, se apelotonan, ¿vale? Entonces se forma como un exoesqueleto y así pueden estar mucho tiempo, haciendo las funciones vitales mínimas, mínimas, mínimas y así no morir. Y cuando ya las condiciones ambientales vuelven a ser buenas, se desencapsulan y ya pueden hacer su ciclo vital otra vez perfectamente. Eso hace la tuberculosis, por ejemplo, que es una bacteria muy común, sobre todo en Europa y África, en Norteamérica no…
Significado #1 · Palabras #1
Sara Robisco continúa explicando el proceso de experimentación, detallando que los investigadores han reproducido un experimento previo y se enfrentan a desafíos como la selección de membranas adecuadas para capturar microorganismos.
Habla: Sara RobiscoSignificado #1 · Palabras #1membranas para capturar microorganismosbacillus subtilis experimento reproducidopseudohalteromonas aloplantis selección membranasarquea aloferax volcani desafío experimentaciónbacillus subtilis en el sueloencapsulamiento de bacteria para sobrevivirtemperaturas hasta 100 grados bacillus subtilisexoesqueleto bacterial para funciones vitales…una potencia de cálculo enorme, simplemente con un PC chiquitito te va el día. Entonces esa aproximación es muy buena, pero claro, como decimos, de dicho al hecho hay un trecho; entonces esta gente en su trabajo se lo pasaron muy bien. ¿Qué han hecho? Han reproducido el experimento porque además y han descubierto otro problema. Dice: vale, ¿qué membrana elegimos? ¿y con qué bacterias, con qué microbios practicamos? Pues los he hecho spoiler varias veces y han elegido tres bacterias: han cogido Bacillus subtilis, Pseudohalteromonas aloplantis y una arquea, dos bacterias y una arquea, la arquea Aloferax volcani. ¿Y ¿Por qué las han elegido? Pues es muy curioso, porque esta gente se ve que son biólogos, entonces han hecho un estudio de bacterias y arqueas y han descubierto que Bacillus subtilis es un bacilo que se encuentra en todo el suelo repartido por toda la tierra. Tiene una capacidad que es muy buena y es que resiste temperaturas hasta 100 grados porque una capacidad que tienen algunas bacterias, no todas, es que se encapsulan, que es el encapsulamiento; el encapsulamiento de una bacteria es que su membrana la ponen en condiciones desfavorables, mucho frío, mucho calor, para evitar desecarse y morir. Su bacteria vuelve muy dura, muy dura, muy dura, se apelotonan, ¿vale? Entonces se forma como un exoesqueleto y así pueden estar mucho tiempo, haciendo las funciones vitales mínimas, mínimas, mínimas y así no morir. Y cuando ya las condiciones ambientales vuelven a ser buenas, se desencapsulan y ya pueden hacer su ciclo vital otra vez perfectamente. Eso hace la tuberculosis, por ejemplo, que es una bacteria muy común, sobre todo en Europa y África, en Norteamérica no…
Sara Robisco explica cómo Pealoplantis, utilizada como control en un experimento para detectar vida en Marte, reacciona al quimiofector al atravesar la membrana.
Habla: Sara RobiscoSignificado #3 · Palabras #3pealoplantis detecta vida en martequimiofector reacción membrana pealoplantisalloplanctis cinco seis horasb subtilis muchas horas…Pealoplantis, se empezó poniendo en el estudio como control porque no se siente atraída por este quimiofector. al contrario, los estudios hasta ahora demostraban que le repelía, entonces dijeron vamos a ponerla porque le arrepele, vamos a ver qué pasa Bueno, pues ¿qué pasa? Que cuando atraviesan la membrana y se van al quimiofector se quedan quietas. Dicen: esto es para mí, esto es para mí; pues ya me quedo quietecita, ya no me muevo más, y ese es el momento de hacer una única foto que puede ser una a la hora y otras tres horas porque se ha estudiado que estas bacterias a partir de cinco o seis horas en el caso de Alloplanctis y me parece que muchas más horas en B. subtilis empiezan ya a crear. Colonias y no les interesa esas colonias y les quieren ver el microorganismo que ha llegado. Entonces, según se posan a la hora, hay una primera foto a cabo de una hora y otra a las tres horas y detectas las bacterias, los elementos que hay y los cuentas.…
Sara Robisco describe los resultados de un experimento realizado con bacterias y una arquea, donde se observó un aumento significativo en la población entre un 300% y un 400% tras la aplicación de ciertas concentraciones.
Habla: Sara RobiscoSignificado #7machine learning detección vida martequimiofector comparado con algasmedio cultivo estándar bacteriascultivo de agar como controlarquea coloniza con concentracionesbacterias aumentan población 300-400experimento sara robisco bacterias arquea…muy bien porque el tiempo de computación y el tiempo de entrenamiento este sistema de Machine Learning es muy sencillito, necesitas muy poquitos recursos y muy poquito tiempo. En un ordenador normal de casa se podría incluso entrenar. Hasta aquí todo bien. Pero, ¿qué pasa? Hemos dicho que han encontrado. Pues mira, han probado con concentraciones de quimiofector y con un medio normal, el típico de la placa del alga. ¿Cómo se llama el alga que ponemos en las placas redondas? Bueno, el típico medio que ponemos en las placas de cultivo de bacterias. El cultivo de agar es el medio que han cogido como medio control y luego los medios con el eserina. Bueno, pues han hecho el experimento y efectivamente con las concentraciones que ellos ponen, tanto las dos bacterias como la arquea colonizan, vamos, colonizan, se posan y aumentan entre un 300-400% la población que hay. Claro, de no tener nada a tener un montón, o sea, es ese aumento de población. ¿Qué pasa? ¿Qué dice Sara? Pero una de ellas se sentía repelida, ¿qué ha pasado? Pues que los estudios demostraban que se sentía repelida con una concentración de menos minimoles de L-serina, pero se han dado cuenta de que a mayor concentración sí que se siente atraída.…
Juan Carlos Gil describe los resultados obtenidos al comparar un modelo completo con uno linealizado para simular un experimento, mencionando valores propios específicos relacionados con la dinámica del frente.
Habla: Juan Carlos GilPalabras #19valor propio cero estado estacionariomodo fundamental avance del frente 0 75eigen value 2 52 modo de recesióndinámica del problema valor eigen 2 52…hacia la solución respecto del tiempo de 0 a 1, está normalizado. El modelo completo es completo y el lineal utiliza solo 3 modos, muy curioso; dicen que tienen que subir hasta 100 modos para recuperar la dinámica no lineal y aún así se quedan solo con 3 y. Les va bastante bien: el cero, que es el estado estacionario, claro, el de valor propio 0.75, que dicen resulta ser el modo fundamental de avance del frente y luego otro que es necesario para reproducir la dinámica del problema, cuyo valor Eigen Value es 2.52, que llaman modo de recesión y este da cuenta de un efecto también simpático que se observa y es que cuando avanza el frente colorado y se mete un poquito en una rama lateral del laberinto, no en la que lleva a la solución, bueno, pues pasado un tiempo se retrae, dice, ah no, no, que por aquí no es y la tinta roja se ve como se retrae y eso ocurre porque según avanza la tinta roja por su camino adecuado, pues la…
Juan Carlos Gil describe los resultados obtenidos al comparar un modelo completo y uno linealizado para simular un experimento, destacando la capacidad del modelo para reproducir la posición del frente de forma semi-cuantitativa.
Habla: Juan Carlos GilPalabras #12eigenvalues experimento artículo basemodelo completo reproduce frente coloradoefecto retroceso figura tresmodelo lineal captura forma vuelta…esto de que puedan discriminar la tarea de cada modo, o sea uno. A mí me ha dejado sorprendido, no lo cuentan nada, yo aquí... A ver, los datos suplementarios es gigante y reconozco que no me lo he leído entero, ¿vale? O sea, a lo mejor ahí se lo cuentan en Detalle, pero en el artículo base, de repente dicen Eigenvalues: 0, 0.75 y 2.52. Un poco de magia y es súper chulo que cada uno tenga una función, sí. Este efecto de retroceso se ve en el inset de la figura 3, donde se ve, bueno, pues que el modo completo lo reproduce de forma semi-cuantitativa. Mientras que el lineal, este efecto concreto, pues nada, da la forma de vuelta; por lo menos hay una forma, pero desde luego no es semi-cuantitativa. Bueno, en resumen, el modelo este captura fenomenalmente, bastante bien, desde luego de forma semi-cuantitativa, la posición del frente colorado, súper chulo. Hay un efecto claro que se ve en la figura y que los autores no discuten; de nuevo no sé por qué, porque a mí me ha llamado mucho la atención y es que al principio del avance el modelo completo funciona mejor, pero hay una especie de cambio de régimen, cambio…