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Isabel CorderoAlberto ApariciBorja TosarJuan Carlos GilFrancis VillatoroHéctor Socascern dona agua pesada uamgarrafas polietileno cern uamagua pesada ultra pura análisisagua pesada cern universidad autónomamicroscopía de fluorescencia en agua pesadatinción ribosomal de segmentos 16sarqueas en garrafas abandonadasprotocolo fish para ribosomas activosdetección de bacterias con fisharqueas no detectadas con fishviñeta xkcd científicos laboratorioarqueas y enfermedades humanasrespiradores de metano y adaptaciónopinión personal sobre arqueasarqueas conquistando la tierramicroscopio y voz inesperadatinte para todo el adncélulas vivas y muertasARN ribosomalJuan Carlos GilCERNUniversidad Autónoma de MadridFISHXKCDDuneADNDepartamento de Física de MaterialesCSIC
Arqueas en garrafas abandonadas
Con
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Juan Carlos Gil describe cómo garrafas de agua pesada donadas por el CERN a la Universidad Autónoma de Madrid en 1989 fueron almacenadas durante más de 30 años antes de ser examinadas.
…de Polímero CSIC de la Universidad Autónoma de Madrid, del Laboratorio Subterráneo de Caunfranc en Huesca y de la Universidad de Tubinga en Alemania, con lo cual el espectro de experiencia es amplísimo: biología molecular, geociencia e incluso microbiología. El desencadenante de este lío fue el descubrimiento, o quizá debería decir redescubrimiento, porque lo pusieron ahí en manos, de tres garrafas de polietileno de muy alta densidad, que es un plástico extraordinario, muy bueno para almacenamiento químico y biológico; con agua pesada ultra pura se hizo un análisis y la que menos tenía de las tres era 99,4 y la que más tenía prácticamente era 100%, o sea, era completamente agua pesada que fueron donadas en su día por el CERN al Departamento de Física de Materiales de entonces de la Facultad de Ciencias de la Universidad Autónoma de Madrid en 1989, 1989. No he encontrado; no existe referencia de qué demonios, para qué demonios se donó y qué hacía ahí, ¿no? Esperando. Bueno, pues estas garrafas de agua pesada purísima han estado selladas a oscuras, sin nutrientes, olvidadas y abandonadas ahí en un sótano durante más de 30 años, hasta que hace un par de años a alguien se le ocurrió mirar dentro. Supongo que sin mucha esperanza, ¿no? Bueno, pues se le ocurrió a ver si había algún bichito. Utilizaron microscopía de fluorescencia, utilizaron tinción específica para el ARN ribosomal de los segmentos 16S de bacterias y otra tinción específica para arqueas. El protocolo de esto se llama Hibridación Fluorescente In-Situ, FISH, como pescado en inglés. Bueno, el caso es que estas extinciones detectan ribosomas activos, es decir, actividad metabólica, vamos, bichitos vivos y coleando. Y vaya si detectaron montones y montones de bacterias; arqueas no apareció ninguna, ¿vale? Pero aparecieron montones y montones de arqueas. Recordaba cuando preparaba esto hace un par de semanas; había una tira de XKCD, que todos los frikis conoceremos, en una de sus viñetas se ve que están varios científicos en un laboratorio y dice uno: Es curioso cómo, pese a ser una De las ramas principales del árbol de la vida, no se conoce ninguna especie de arquea que cause enfermedades en humanos. Al que otro responde: mira, personalmente creo que es porque esos respiradores de metano, dicen, son demasiado raros e incompetentes como para saber hacernos daño, aunque quisieran. Y entonces desde un portaobjetos que se ve ahí al fondo, en un Microscopio, sale una vocecita así pequeña que dice: ¡eh! que os estoy oyendo y acaba debajo de la viñeta un mensaje, se supone que de alerta o algo, tras escuchar una conversación entre científicos las arqueas han empezado a conquistar la Tierra. Efectivamente, las arqueas son muy raras aquí no aparecieron. Hicieron luego otra atención más, complementaria, que tiñe todo el ADN, sin saber si está vivo o no, si es mitocondrial o no. Por lo tanto, determinas todas las células que hay ahí, tanto vivas como muertas, ¿vale? Lo que permitió, comparando con las tensiones anteriores, ver qué porcentaje de bichitos estaban vivos en este momento. Bueno, pues entre un 35 y un 55 de los bichitos estaban vivitos y coleando. Todos estos números que os cuento están en el panel A de la figura 1. O sea, quiero decirlo despacio y captando vuestra atención: descubrieron una suerte de oasis microbiano que ha…
Significado #1 · Palabras #1
Juan Carlos Gil describe cómo garrafas de agua pesada donadas por el CERN a la Universidad Autónoma de Madrid en 1989 fueron almacenadas durante más de 30 años antes de ser examinadas.
Habla: Juan Carlos GilSignificado #1 · Palabras #1cern dona agua pesada uamgarrafas polietileno cern uamagua pesada ultra pura análisisagua pesada cern universidad autónomamicroscopía de fluorescencia en agua pesadatinción ribosomal de segmentos 16sarqueas en garrafas abandonadasprotocolo fish para ribosomas activosdetección de bacterias con fisharqueas no detectadas con fishviñeta xkcd científicos laboratorioarqueas y enfermedades humanasrespiradores de metano y adaptaciónopinión personal sobre arqueasarqueas conquistando la tierramicroscopio y voz inesperadatinte para todo el adncélulas vivas y muertas…de Polímero CSIC de la Universidad Autónoma de Madrid, del Laboratorio Subterráneo de Caunfranc en Huesca y de la Universidad de Tubinga en Alemania, con lo cual el espectro de experiencia es amplísimo: biología molecular, geociencia e incluso microbiología. El desencadenante de este lío fue el descubrimiento, o quizá debería decir redescubrimiento, porque lo pusieron ahí en manos, de tres garrafas de polietileno de muy alta densidad, que es un plástico extraordinario, muy bueno para almacenamiento químico y biológico; con agua pesada ultra pura se hizo un análisis y la que menos tenía de las tres era 99,4 y la que más tenía prácticamente era 100%, o sea, era completamente agua pesada que fueron donadas en su día por el CERN al Departamento de Física de Materiales de entonces de la Facultad de Ciencias de la Universidad Autónoma de Madrid en 1989, 1989. No he encontrado; no existe referencia de qué demonios, para qué demonios se donó y qué hacía ahí, ¿no? Esperando. Bueno, pues estas garrafas de agua pesada purísima han estado selladas a oscuras, sin nutrientes, olvidadas y abandonadas ahí en un sótano durante más de 30 años, hasta que hace un par de años a alguien se le ocurrió mirar dentro. Supongo que sin mucha esperanza, ¿no? Bueno, pues se le ocurrió a ver si había algún bichito. Utilizaron microscopía de fluorescencia, utilizaron tinción específica para el ARN ribosomal de los segmentos 16S de bacterias y otra tinción específica para arqueas. El protocolo de esto se llama Hibridación Fluorescente In-Situ, FISH, como pescado en inglés. Bueno, el caso es que estas extinciones detectan ribosomas activos, es decir, actividad metabólica, vamos, bichitos vivos y coleando. Y vaya si detectaron montones y montones de bacterias; arqueas no apareció ninguna, ¿vale? Pero aparecieron montones y montones de arqueas. Recordaba cuando preparaba esto hace un par de semanas; había una tira de XKCD, que todos los frikis conoceremos, en una de sus viñetas se ve que están varios científicos en un laboratorio y dice uno: Es curioso cómo, pese a ser una De las ramas principales del árbol de la vida, no se conoce ninguna especie de arquea que cause enfermedades en humanos. Al que otro responde: mira, personalmente creo que es porque esos respiradores de metano, dicen, son demasiado raros e incompetentes como para saber hacernos daño, aunque quisieran. Y entonces desde un portaobjetos que se ve ahí al fondo, en un Microscopio, sale una vocecita así pequeña que dice: ¡eh! que os estoy oyendo y acaba debajo de la viñeta un mensaje, se supone que de alerta o algo, tras escuchar una conversación entre científicos las arqueas han empezado a conquistar la Tierra. Efectivamente, las arqueas son muy raras aquí no aparecieron. Hicieron luego otra atención más, complementaria, que tiñe todo el ADN, sin saber si está vivo o no, si es mitocondrial o no. Por lo tanto, determinas todas las células que hay ahí, tanto vivas como muertas, ¿vale? Lo que permitió, comparando con las tensiones anteriores, ver qué porcentaje de bichitos estaban vivos en este momento. Bueno, pues entre un 35 y un 55 de los bichitos estaban vivitos y coleando. Todos estos números que os cuento están en el panel A de la figura 1. O sea, quiero decirlo despacio y captando vuestra atención: descubrieron una suerte de oasis microbiano que ha…
Juan Carlos Gil explica que las bacterias adaptadas al agua pesada podrían estar utilizando carbono proveniente de la degradación del plástico de las garrafas como fuente de recursos.
Habla: Juan Carlos GilSignificado #3 · Palabras #7carbono de degradación del plásticogenes de polietileno en bacteriasgarrafas como fuente de recursos…El agua, en este caso, pesada. En Dune, me acuerdo cuando no recuerdo los nombres, escupió en la mesa de negociación; era máximo honor, te doy mi agua y los otros se quedan, que choque cultural. Choque cultural, lost in translation. Un tío majo, Stilgar. Bueno, pues fíjate, carbono es fundamental. Todas las moléculas orgánicas tienen carbono; razonan los autores que es probable que utilicen el carbono proveniente de la degradación del propio plástico de las garrafas. Ahí va, vale. Y esto es una hipótesis, pero bueno, se sustenta en el hecho de que detectan genes asociados típicamente a la degradación del polietileno. Para que eso está bien sustentado; pero claro, bien, carbono tienes ahí. Para tirar de las paredes, no sé cuánto más tiempo les queda. Pero hay otros oligoelementos, no, no, otros elementos imprescindibles para la vida como nitrógeno y azufre. Pero da igual, una vez que se coman las paredes ya serán libres. Bueno, tienes que…