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Luisa AchaerandioBorja TosarFrancis VillatoroHéctor SocasMaría Ribesviroid-like colonies microbioma humanoelementos heredables de arn cel 2024muestras del microbioma humanoconcepto viroide agentes heredables arnestructura arn escalón pequeñoagente infeccioso plantas viroidemacromolécula biológica ajuste finoarn circular celmarco de lectura proteínaribocimas martillo harborenzimas ribocimas replicaciónCELARNViroideOpen Frame ReadHarbor RibocimasARN mensajeroLuisa AchaerandioHéctor Socas14 de noviembre de 2024Microbioma humanoMarcos de la PeñaUniversidad de Valencia (UPV)CEDARN circular
ARN circular CEL
Con
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Luisa Achaerandio explica las diferencias entre un nuevo tipo de ARN circular y los viroides, basándose en información del artículo publicado por CEL.
…estuvieron en La Revuelta, en Radio Televisión Española. Es verdad que viendo, por ejemplo, nada más que parándote con el nombre de Marcos de la Peña, aparece en X y creo que aparece justo como un pequeño clip de vídeo donde se ve en ese programa, ¿sabes? Hablando precisamente de la importancia de la ciencia, vale, pues nada más que el artículo, yo lo recomiendo que lo veáis porque es un artículo muy bonito. Es un artículo que claramente ya te dice con el título de qué estamos hablando, que supongo que lo aportaremos en las notas del episodio, pues como siempre, ya te lo está aclarando, te dice Viroid-like colonies of human microbiomes, o como se pronuncia. Pues básicamente se traduce como unos microbiomas, o sea, en el microbioma humano, es decir, dentro, en concreto, utilizando o extrayendo muestras del microbioma humano se han encontrado unos colonizadores que se parecen, B-Joid-like, se parecen a unas entidades, por así llamarlo, o como lo llaman en este artículo del CEL de 2024, lo llaman elementos heredables de ARN, agentes o elementos genéticos. ¿Esto qué significa? Pues a lo mejor hay que empezar por el concepto de viroide, que digamos es un escalón un poco más pequeño de estructura de ARN. Ya te digo, aquí me he encontrado yo que no sabía bien si empezar desde el principio a principio o simplemente pues centrarme en este punto de lo que era un viroide en sí. Un viroide básicamente es un agente infeccioso para plantas, como se puede entender generalmente ¿vale? Es como se le conoce de manera general y digamos que su forma y comportamiento se parece mucho a este nuevo agente heredable, pero no del todo. Esto digamos que es un ajuste fino a la hora de poder diferenciar un agente biológico de otro en realidad una macromolécula biológica o una biomolécula de otra ¿vale? Estamos hablando de un ajuste fino. ¿En qué se diferencian? Pues como os decía en el artículo del CEL se ve clarísimo. Es un ARN circular, básicamente, que yo tengo aquí un dibujito que se ve muy claro, donde la diferencia con un viroide es que tiene un Open Frame Read, que es básicamente un marco de lectura, es decir, que se tiene en su interior la información para traducir una proteína muy concreta con la que se le pueda identificar y también porta ribocimas, ribocimas en forma de martillo que se le llama, ¿vale? Harbor Ribocimas, ¿vale? Son básicamente unas enzimas que en el momento en el que este agente infeccioso se introduce en su huésped utiliza esa maquinaria celular para crear estas ribocimas y poder replicarse. Entonces se diferencia precisamente en eso, en que si hablamos de viroides no estamos hablando de una biomolécula que tenga ese open frame, ese marco de lectura abierto. No tiene esa capacidad de identificarse con unas proteínas concretas y pues eso…
Significado #1 · Palabras #1
Luisa Achaerandio explica que para entender la situación actual, es necesario leer en profundidad un artículo de referencia publicado por Cel el 14 de noviembre de 2024.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #5 · Palabras #6artículo de referencia cel noviembre 2024autores artículo cel 14 noviembre 2024luisa achaerandio analiza artículo cel…en Arcai un último artículo relacionado con el anterior al que hace referencia esta nota de prensa y precisamente nos hace recordar esta noticia que hace un año se había dado a conocer a través de estos medios más populares. Entonces, ¿de qué va todo esto? ¿A qué se está refiriendo? Pues una vez ya que te paras a conocerlo, el primer artículo que hay que leerse en profundidad es el de Cel, el de referencia, de noviembre de 2024, el 14 de noviembre de 2024, cuyos autores pues entre ellos se encuentra bueno ahora me toca a mí decir un apellido complicado. Celudet, Robert Edgar, María José López Galeano. Es decir, tenemos aquí una colaboración también donde está, si no recuerdo mal, la Universidad de Valencia, la UPV, si no recuerdo mal. Y Marcos de la Peña, entre otros autores, ¿no? El primero es el Celudez,…
Luisa Achaerandio explica las diferencias entre un nuevo tipo de ARN circular y los viroides, basándose en información del artículo publicado por CEL.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #1 · Palabras #1viroid-like colonies microbioma humanoelementos heredables de arn cel 2024muestras del microbioma humanoconcepto viroide agentes heredables arnestructura arn escalón pequeñoagente infeccioso plantas viroidemacromolécula biológica ajuste finoarn circular celmarco de lectura proteínaribocimas martillo harborenzimas ribocimas replicación…estuvieron en La Revuelta, en Radio Televisión Española. Es verdad que viendo, por ejemplo, nada más que parándote con el nombre de Marcos de la Peña, aparece en X y creo que aparece justo como un pequeño clip de vídeo donde se ve en ese programa, ¿sabes? Hablando precisamente de la importancia de la ciencia, vale, pues nada más que el artículo, yo lo recomiendo que lo veáis porque es un artículo muy bonito. Es un artículo que claramente ya te dice con el título de qué estamos hablando, que supongo que lo aportaremos en las notas del episodio, pues como siempre, ya te lo está aclarando, te dice Viroid-like colonies of human microbiomes, o como se pronuncia. Pues básicamente se traduce como unos microbiomas, o sea, en el microbioma humano, es decir, dentro, en concreto, utilizando o extrayendo muestras del microbioma humano se han encontrado unos colonizadores que se parecen, B-Joid-like, se parecen a unas entidades, por así llamarlo, o como lo llaman en este artículo del CEL de 2024, lo llaman elementos heredables de ARN, agentes o elementos genéticos. ¿Esto qué significa? Pues a lo mejor hay que empezar por el concepto de viroide, que digamos es un escalón un poco más pequeño de estructura de ARN. Ya te digo, aquí me he encontrado yo que no sabía bien si empezar desde el principio a principio o simplemente pues centrarme en este punto de lo que era un viroide en sí. Un viroide básicamente es un agente infeccioso para plantas, como se puede entender generalmente ¿vale? Es como se le conoce de manera general y digamos que su forma y comportamiento se parece mucho a este nuevo agente heredable, pero no del todo. Esto digamos que es un ajuste fino a la hora de poder diferenciar un agente biológico de otro en realidad una macromolécula biológica o una biomolécula de otra ¿vale? Estamos hablando de un ajuste fino. ¿En qué se diferencian? Pues como os decía en el artículo del CEL se ve clarísimo. Es un ARN circular, básicamente, que yo tengo aquí un dibujito que se ve muy claro, donde la diferencia con un viroide es que tiene un Open Frame Read, que es básicamente un marco de lectura, es decir, que se tiene en su interior la información para traducir una proteína muy concreta con la que se le pueda identificar y también porta ribocimas, ribocimas en forma de martillo que se le llama, ¿vale? Harbor Ribocimas, ¿vale? Son básicamente unas enzimas que en el momento en el que este agente infeccioso se introduce en su huésped utiliza esa maquinaria celular para crear estas ribocimas y poder replicarse. Entonces se diferencia precisamente en eso, en que si hablamos de viroides no estamos hablando de una biomolécula que tenga ese open frame, ese marco de lectura abierto. No tiene esa capacidad de identificarse con unas proteínas concretas y pues eso…
Luisa Achaerandio explica cómo las técnicas de laboratorio para analizar biomoléculas deben complementarse con bioinformática para comparar secuencias de ARN o proteínas con bases de datos existentes.
Habla: Luisa AchaerandioPalabras #3bioinformática para secuencias de arnsecuencia de aminoácidos en base de datoshomologías entre proteínas y viroidesartículo cel del 2024molécula de arn circular obeliscomuestras y análisis bioinformático obeliscoforma bastoncillo o varilla obeliscoluisa achaerandio nombra entidad biológica…estaríamos extrayendo ARN, ¿vale?, ácido ribonucleico de ese microbioma humano en concreto de las heces y de la saliva. Y para ello necesitan muchas técnicas de laboratorio, entre las que se encuentran pues Northern Plot y técnicas muy concretas, ¿vale? entonces una vez que ya lo tienes digamos estas técnicas de laboratorio se tienen que complementar con técnicas de bioinformática que básicamente es trasladar esa secuencia de aminoácidos partimos de la ARN o de las proteínas que encontremos en una muestra y esa secuencia de aminoácidos hay que pasarla a una base de datos y compararla pues con secuencias anteriores que tenemos tanto de nucleótidos como de proteínas y en ese proceso de comparación se pueden establecer lo que se llaman homologías por ejemplo con las proteínas o secuencias parecidas y se puede digamos que sacar un parecido o una diferencia entre este viroide que te digo y lo que se ha descubierto nuevo y se establece como nuevo. De hecho, en el artículo del CEL del 2024, Es el artículo en el que se le llama por primera vez obelisco. Y tiene que ser muy emocionante, realmente, ponerle el proceso ahora mismo en vivo de ponerle el nombre a una entidad biológica que realmente es nueva, pero que necesita todo este proceso tan grande de utilizar las muestras, de obtener las muestras, de hacer un proceso de laboratorio, de utilizar la bioinformática; es un grupo muy grande y de luego obtener unos resultados que nos llevan a esta conclusión. Entonces, es importante decir que se le llama obelisco simplemente esto por la forma que tiene en sí esta molécula de ARN circular que si la pudierais ver en el artículo, lo mismo la podía haber llamado obelisco que se podía haber llamado bastoncillo o varilla porque realmente esa es la forma que puede evocar esta biomolécula orgánica. Con un poquito de imaginación, parece un telescopio. Sí, también es verdad. Algunos dirán que es un símbolo fálico, no sé qué Te iba a preguntar, Luisa, porque para mí me lo has explicado de forma muy básica para la gente que no sabe y me gustaría trasladar eso también a nuestros oyentes porque habrá algunos también que también…
Héctor Socas interrumpe a Luisa Achaerandio para aclarar la naturaleza de los viroides, describiéndolos como cadenas pequeñas de ARN circulares.
Habla: Héctor SocasSignificado #7 · Palabras #4viroides cadenas pequeñas de arnnucleótidos en forma circularluisa achaerandio aclara viroides…sin encapsulado. O sea, el virus viene con una cápside proteica, ¿no? O sea, el virus es un virus tiene dos partes: tiene el ARN, que es lo que se replica, o el ADN, y una envoltura proteica que lo protege, ¿no? Una cápsula, digamos, dentro de una cápsula. Nada, a lo loco, al aire, es solamente una cadenita muy pequeña de ARN que pueden ser cientos de nucleótidos, además en forma circular, que no tiene extremos porque está todo conectado y eso lo hace un poquito más estable y que infecta células de plantas y dentro de las células se puede No, no, perdona, perdona Héctor No, no, los viroides son Los que infectan Plantas. Digamos plantas, pero los obeliscos es como si fuera una especie de evolución de la naturaleza. Los obeliscos ya se ha demostrado. Sí, pero yo soy los viroides. Ah, vale, los viroides en sí, vale, vale, ok. Sí, los viroides sí…
Luisa Achaerandio explica la naturaleza y características de los 'obeliscos', entidades biológicas descubiertas recientemente en bioquímica, destacando su estabilidad debido a su estructura circular de ARN.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #3 · Palabras #2árn circular cerrado covalentementeexonucleasas afectan al arn mensajeroestabilidad de los obeliscos luisa achaerandioácido ribonucleico estructura circular…y Luisa nos estaba contando esta fascinante historia de los viroides y los obeliscos, que es un descubrimiento reciente de la bioquímica y al contrario que los viroides, estos obeliscos sí que están además dentro del cuerpo humano, en nuestra microbiota. Exactamente, por ahí van los tiros entonces me gustaría recordar que un obelisco es un ARN es decir un ácido ribonucleico circular cerrado covalentemente es decir que al estar cerrado no le afectan unas enzimas que se llaman exonucleasas con lo cual lo hacen estable porque eso es uno de los problemas que tiene el ARN que por ejemplo el ARN mensajero determinados tipos de ARN que hay muchísimos Las vacunas de la COVID, ¿no? El RNA mensajero de las vacunas Exactamente, hay muchísimos, sí, y uno de los problemas que tenían era eso, que al ser moléculas abiertas y lineales, enseguida se degradaban y se veían afectadas por determinadas enzimas, por…
Luisa Achaerandio explica por qué los investigadores decidieron nombrar una nueva entidad 'obelisco' en lugar de 'varilla', haciendo referencia a la forma de ARN mensajero cerrado covalentemente y comparándola con los obeliscos egipcios.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #13forma de arn mensajero obeliscoobelisco egipcio forma varillaentidad arn mensajero covalente…hacer una pregunta muy tonta: ¿Por qué el nombre? Me encanta que me lo digas porque realmente es algo que yo creo que es la pregunta como más rápida, pero también tiene su relevancia y básicamente si te vas al artículo del CED del 2024 es cuando los autores. Por la forma de ARN mensajero que está cerrado covalentemente y que tiene esa forma de varilla, hombre, podían haberle puesto “varilla” pero quedaba como mucho menos atractivo. Entonces decidieron ellos de manera personal decir: bueno pues tengo la oportunidad de decir que esta es una nueva entidad y la vamos a llamar así porque nos recuerda a un obelisco, como los obeliscos egipcios, ¿no? Ok, yo preguntaba porque cuando presentábamos los temas estábamos haciendo chistes entre nosotros: si obelisco o asterisco. Y hablando de obeliscos egipcios, María, yo no sé si habría obeliscos en este puerto que han descubierto sumergido en el fondo del mar;…