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Luisa AchaerandioFrancis VillatoroHéctor SocasBorja TosarGastón Giribetbacterias consumen nanopetalimentación bacterias con petazúcar como alimento alternativobioquímica y tema energéticoFrancis VillatoroPETLuisa AchaerandioEscherichia coliCRISPR-CasPCACIMESSkyMálagaSEMvariante S1medio LuriaBrozAgarcepa K12
Alimentación bacterias con PET
Con
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Francis Villatoro explica que mantener un bioreactor para contener bacterias que degradan nanopetróleo es costoso, pero permite controlar su alimentación y fomentar el consumo de nanopetróleo en lugar de azúcar.
…es relativamente fácil retener los microplásticos y las cosas que tienen un tamaño micrométrico y submicrométrico, pero cuando bajas ya a la escala nanométrica del orden de 100 nanómetros, 80 nanómetros, es extremadamente difícil hacer filtros para eso, ¿no? Entonces, tener algún mecanismo biológico, que hombre, es un bioreactor y mantener un bioreactor tiene un alto coste, pero bueno, tú mantienes vivas a las bacterias, estas bacterias que consumen este nanopet, este pet, se pueden alimentar de él, pueden crecer en presencia de pet, con lo que le puedes dar menos alimento para provocar las que le das menos azúcar, que no vivan felices con el azúcar y quieran consumir el pet y habrá que mejorar, por supuesto, toda la bioquímica y el tema energético para que sea preferido. Este trabajo no está ya definitivo para llevarlo a implementar. Que da muchísimas, te puedo decir, puede que décadas de trabajo. Pero bueno, es un trabajo muy prometedor y vendría en eso, en bioreactores específicamente, por ejemplo, en lugares donde tú…
Significado #1 · Palabras #1
Luisa Achaerandio destaca la relevancia de la degradación del plástico como solución al problema de contaminación ambiental, mencionando el potencial uso de Escherichia coli para este fin.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #20degradación plástica bacteria escherichia colicontaminación ambiental consumo textilplásticos de un solo uso problema…sale unos días después, en este caso el 20 de agosto Siempre la nota de prensa está asociada un poquito al clickbait, porque realmente dice palabras como reprogramación, bacteria, ya nada más que de entrada, suena bastante interesante y aprender, el concepto De aprender que habría que llamarlo de otra manera. Y lo que sí es muy interesante es la parte de degradar plástico, sobre todo por el problema que estamos teniendo hoy en día de contaminación del medio ambiente, por los problemas que tenemos tanto de consumo a nivel de textil, de plásticos de un solo uso y demás. Entonces pues realmente parece que tiene muy buena pinta que utilicemos a nuestra querida E. coli, ¿vale? Llamarla Escherichia Coli es peor que decir mi apellido, entonces prefiero en general, en general se suele tender a decir E. coli y bueno pues... Te confieso que lo busqué porque como tiene esas THs no sabía si había que pronunciarlas al estilo, yo digo es…
Luisa Achaerandio explica que la cepa K12 de Escherichia coli es el punto de partida para sus investigaciones y se utiliza como base para buscar formas de degradar plásticos.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #14reprogramación genética escherichia colidegradación plástica bacteria e colicepa k12 punto de partida…que en Málaga no mataremos a nadie desde el laboratorio; o sea, cuando estamos allí. Pero es verdad que es una conocida muy común en todos los experimentos tanto a nivel de instituto como a nivel de formación profesional como a nivel de investigación en General y es la cepa K12, pero claro, desde la cepa K12 no podemos hacer nada, sino que ese es el punto de partida. Utilizamos nuestra E. coli, nuestra cepa K12 y a partir de ahí lo que hacemos es buscar en esta bacteria: ¿Cómo? ¿Qué puedo hacer yo con esta bacteria? ¿Qué lugar de esta bacteria, porque ya os digo que hay que hilar bastante fino, puedo utilizar para que me sirva para degradar este plástico? Entonces, los investigadores lo que hacen lo primero es buscar en el genoma de la E. coli dos proteínas en concreto, que son la LSRB y la SSUA. Para encontrar estas proteínas tienen que utilizar bioinformática; es decir, tú necesitas saber, lo primero que…
Luisa Achaerandio explica cómo se incorporan enzimas de otras bacterias a Escherichia coli para dotarla de una nueva capacidad, permitiéndole degradar plástico sin perder sus funciones originales.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #2 · Palabras #2enzimas bacterias degradan plásticoescherichia coli degrada petpolietileno tereftalato nanométrico petdegradación pet por escherichia coliprotocatecuato pca molécula químicabacteria reutiliza protocatecuato pcainvestigadores artículo maravilla…que os digo de la triada catalítica, que se compone de tres aminoácidos, que son serina, histidina y aspartato, no confundir con aspartamo, que es un edulcorante, ¿vale? Es importante decir todo. y básicamente esta triada catalítica tú la identificas en otras Enzimas de otras bacterias que suelen que ya de manera natural pueden degradar plástico pero se la incorporas a esta bacteria en estos lugares. Con lo cual la dotas de una nueva capacidad sin que pierda sus capacidades anteriores, es decir, esta bacteria puede seguir alimentándose de manera normal o, que eso es lo chulo, puede coger el polietileno tereftalato nanométrico, es decir, nuestro conocido PET; sabía que ibas a poner esa cara porque ya os digo que lo más difícil de esta edición no es mi apellido. Y básicamente con este PET que todos conocemos pero es verdad que no lo conocemos por el nombre extendido de la molécula, pues hace capaz esta nueva capacidad, hace capaz de degradar esta molécula y llegar a obtener el protocatecuato, es decir, el PCA. PCA es una molécula que te sirve para hacer un montón de cosas a nivel químico, puedes hacer colorantes, puedes hacer fármacos, la propia bacteria la puede reutilizar, o sea que básicamente, y además una cosa muy chula también ocurre aquí, que los investigadores, ya os digo, el artículo es una maravilla, a mí me parece que está súper bien presentado, súper bien organizado y súper bien planteado y muy digamos que Te hace muy fácil su comprensión tal y como está expuesto, narrado. Entonces una cosa muy chula que te pone para que te demuestre que digamos estas bacterias no las estás maltratando, te basas en la colaboración y no en la sustitución o el abuso porque…
Luisa Achaerandio describe el resultado de comparar bacterias modificadas con una variante para degradar plástico, frente a las no modificadas.
Habla: Luisa AchaerandioPalabras #8degradación plástica bacteria escherichia colicurva de crecimiento variante escherichia colibacterias no modificadas mueren…en el laboratorio experimentales de este tipo. Entonces la comparas con la que no tiene esta variante y crecen las dos igual; en el artículo se ve perfectamente con los gráficos. ¿Qué es lo que pasa si utilizas un medio pobre y le echas un polímero plástico? Pues lo que ocurre es que esas bacterias que tienen la variante siguen creciendo, tienen su curva de crecimiento y las que no tienen esa variante ya no se pueden alimentar y mueren. O sea que se ve muy claro con un montón de experimentos que validan su hipótesis y lo que quiere. proponer, que es ese cambio de paradigma biotecnológico para poder aprovechar la capacidad bacteriana y utilizar esta técnica que no lo he dicho Ya os digo, este artículo es que tiene un montón de cosas y sé que me voy a pasar de tiempo, pero es que si no...…
Luisa Achaerandio explica cómo las bacterias modificadas para degradar plástico atraen a otras bacterias, aprovechándose de la degradación inicial.
Habla: Luisa AchaerandioSignificado #5 · Palabras #6degradación plástica bacteria e colimicro nanoplásticos escala nanométricabacterias corum sensi degradación plásticabacteria modificada atrae otras bacterias…ese microscopio y el microscopio, digamos el SEM, que es el microscopio electrónico de escáner, que eso lo tenemos en Málaga, Francis seguro que también lo conoce, en el CIMES, en el Sky, lo tenemos allí y básicamente tú compruebas que eso está muy chulo. ¿Por qué claro, tú necesitas ver esto a escalas nanométricas? Estamos hablando de NPET, no estamos hablando de cualquier tipo de PET, estamos hablando de microplásticos, no, micro nanoplásticos en este caso. Una cosa muy chula que ocurre es que las bacterias son muy guays y resulta que, no sé si gracias a su corum sensi o no sé por qué, pero se ha comprobado que, claro, donde empieza esta bacteria a degradar el plástico, pues como que se añaden otras, es como que se acuden a la fiesta, por así decirlo. ¿Qué es lo que pasa? Que esas bacterias tienen en comparación, como que se aprovechan un poco de la degradación que hace esta bacteria modificada y entonces pues está también simpático esta parte del artículo. ¿Cómo? Porque ya simplemente me quedaría que se supiera, porque tú te lo estarás preguntando. ¿Pero cómo meto yo esa triada catalítica en ese binding pocket? A lo mejor se lo pregunta alguien, ¿vale? No sé si se lo pregunta alguien, pero es una cosa que…
Francis Villatoro explica cómo se puede modificar una bacteria para que realice dos funciones: su función original para sobrevivir y una nueva función impuesta por el investigador para consumir nanoplásticos.
Habla: Francis VillatoroSignificado #8proteína bacteria funciones supervivenciabacteria consume nanoplásticos bioreactorreprogramación genética escherichia coli…especiales para que se pueda alterar y en el sitio activo, en el lugar en el que se produce la catálisis, la función bioquímica básica de esa proteína le añado un pequeño cambio que permite que en ese sitio también se pueda hacer otra función diferente. Y entonces consigo que una proteína de la bacteria haga dos funciones: la función que hace en la bacteria para la supervivencia de la bacteria y una nueva función que es la que yo le he impuesto para que me sirva como bioreactor y haga lo que yo quiero, que en este caso es consumir nanopets, consumir nanoplásticos. Entonces esta es un poco la idea de esta nueva técnica de rewire, de recableado de la función; es algo de la biología sintética el tratar de modificar funciones que tiene la propia maquinaria celular tratando de afectar lo mínimo al funcionamiento de la propia célula para evitar que con el cambio que yo he hecho pues se crezca más lentamente o crezca peor o…
Francis Villatoro explica que mantener un bioreactor para contener bacterias que degradan nanopetróleo es costoso, pero permite controlar su alimentación y fomentar el consumo de nanopetróleo en lugar de azúcar.
Habla: Francis VillatoroSignificado #1 · Palabras #1bacterias consumen nanopetalimentación bacterias con petazúcar como alimento alternativobioquímica y tema energético…es relativamente fácil retener los microplásticos y las cosas que tienen un tamaño micrométrico y submicrométrico, pero cuando bajas ya a la escala nanométrica del orden de 100 nanómetros, 80 nanómetros, es extremadamente difícil hacer filtros para eso, ¿no? Entonces, tener algún mecanismo biológico, que hombre, es un bioreactor y mantener un bioreactor tiene un alto coste, pero bueno, tú mantienes vivas a las bacterias, estas bacterias que consumen este nanopet, este pet, se pueden alimentar de él, pueden crecer en presencia de pet, con lo que le puedes dar menos alimento para provocar las que le das menos azúcar, que no vivan felices con el azúcar y quieran consumir el pet y habrá que mejorar, por supuesto, toda la bioquímica y el tema energético para que sea preferido. Este trabajo no está ya definitivo para llevarlo a implementar. Que da muchísimas, te puedo decir, puede que décadas de trabajo. Pero bueno, es un trabajo muy prometedor y vendría en eso, en bioreactores específicamente, por ejemplo, en lugares donde tú…