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Silvana TapiaJuan Carlos GilFrancis VillatoroHéctor SocasBorja Tosarmodelo tip 4p 2005 estudio aguaestándar de oro modelos clásicos aguatrabajo abascal y vega modelo aguajl fernández abascal y el aguapolielectrolitos tesis juan carlos gilmodelo tip4p 2005 josé luis fernándezpotenciales profundos artículo científico mayoinvestigación tip4p 2005 juan carlos gilTIP 4P 2005AbascalVegaSPCSPCEJosé Luis Fernández AbascalJuan Carlos GilFrancis Villatoro
TIP 4P 2005
Con
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Juan Carlos Gil explica su criterio para elegir artículos científicos, destacando la importancia del modelo TIP 4P 2005 en el estudio del agua.
…L, es especialmente prometedor para su identificación; aparece entre menos y más 20 grados a temperaturas muy decentes humanas y pocas miles de atmósferas de presión, perfectamente accesibles a cualquier laboratorio. Y por último, y esto me pasa a menudo, por Eso elijo los artículos, pues una cuestión personal. El modelo TIP 4P 2005, os he dicho que es el campeón entre los modelos clásicos del agua, el estándar de oro, incluso a día de hoy, o al menos hasta ayer, hasta que se hizo este trabajo, era de Abascal y Vega, os mencioné. Pues bien, Abascal es mi director de tesis, José Luis Fernández Abascal, cuando yo acabé la tesis en el año 97, donde hice los polielectrolitos que os he comentado antes, pues JL, como le llamamos, se empecé a interesar por el agua, por su modelización, lo que desembocó en este gran hito en 2005, que es posiblemente el más relevante de su carrera Yo no estuve involucrado directamente, aunque lo seguí muy de cerca, así que de alguna forma me considero una especie de tío segundo del modelo, si queréis, o algo así El caso es que leí este artículo; os lo he dicho antes, salió en mayo, o sea que ya lleva unos meses, y me voló la cabeza, porque yo no conocía este asunto de los potenciales profundos; me voló la cabeza que nuestro querido TIP 4P 2005 podría haberse sido superado. Así que espero hasta ahora para contároslo porque al final de cada año solemos reunirnos JL y sus doctores, entre ellos yo, y así hemos hecho hace poco, y entonces hemos hablado sobre todo esto. Me lo han contado en detalle y me lo han empollado para…
Significado #1 · Palabras #1
Juan Carlos Gil continúa explicando la evolución de los modelos utilizados para simular el agua, mencionando el modelo SPC y sus variantes.
Habla: Juan Carlos GilSignificado #3 · Palabras #2modelo spc para macromoléculastip 4p modelo abascal vegasimulación de agua e hielo rígido…para la simulación? Pues el primer modelo moderno se llama ST2 de 1974, una molécula de agua rígida con un centro Leonard Jones y cuatro cargas en disposición tetraédrica; es bastante natural para reproducir la tendencia tetraédrica de las moléculas de agua. En los años 80 llega el modelo SPC, Simple Point Charge, y su variante SPCE, que son muy sencillos, muy simples, muy robustos y todavía a día de hoy se siguen utilizando sobre todo para la envolvente acuosa de macromoléculas, en biología molecular y demás. En 1983 aparece un nuevo modelo llamado TIP 4P; el 4P viene de cuatro points, de cuatro centros de interacción que dio lugar a toda una familia de variantes con cuatro centros, cuyo campeón absoluto es el TIP 4P 2005, publicado por Abascal y Vega en 2005 y que sigue siendo a día de hoy el estándar de oro para simular agua y hielo con modelos rígidos. Pero todos estos modelos tienen una limitación grave y es que obviamente los enlaces, cada oxígeno tiene sus dos hidrógenos apareados de por vida, son sus hidrógenos y esos enlaces no se rompen, no capturan los fenómenos que ocurren en el agua natural como la…
Juan Carlos Gil explica su criterio para elegir artículos científicos, destacando la importancia del modelo TIP 4P 2005 en el estudio del agua.
Habla: Juan Carlos GilSignificado #1 · Palabras #1modelo tip 4p 2005 estudio aguaestándar de oro modelos clásicos aguatrabajo abascal y vega modelo aguajl fernández abascal y el aguapolielectrolitos tesis juan carlos gilmodelo tip4p 2005 josé luis fernándezpotenciales profundos artículo científico mayoinvestigación tip4p 2005 juan carlos gil…L, es especialmente prometedor para su identificación; aparece entre menos y más 20 grados a temperaturas muy decentes humanas y pocas miles de atmósferas de presión, perfectamente accesibles a cualquier laboratorio. Y por último, y esto me pasa a menudo, por Eso elijo los artículos, pues una cuestión personal. El modelo TIP 4P 2005, os he dicho que es el campeón entre los modelos clásicos del agua, el estándar de oro, incluso a día de hoy, o al menos hasta ayer, hasta que se hizo este trabajo, era de Abascal y Vega, os mencioné. Pues bien, Abascal es mi director de tesis, José Luis Fernández Abascal, cuando yo acabé la tesis en el año 97, donde hice los polielectrolitos que os he comentado antes, pues JL, como le llamamos, se empecé a interesar por el agua, por su modelización, lo que desembocó en este gran hito en 2005, que es posiblemente el más relevante de su carrera Yo no estuve involucrado directamente, aunque lo seguí muy de cerca, así que de alguna forma me considero una especie de tío segundo del modelo, si queréis, o algo así El caso es que leí este artículo; os lo he dicho antes, salió en mayo, o sea que ya lleva unos meses, y me voló la cabeza, porque yo no conocía este asunto de los potenciales profundos; me voló la cabeza que nuestro querido TIP 4P 2005 podría haberse sido superado. Así que espero hasta ahora para contároslo porque al final de cada año solemos reunirnos JL y sus doctores, entre ellos yo, y así hemos hecho hace poco, y entonces hemos hablado sobre todo esto. Me lo han contado en detalle y me lo han empollado para…
Francis Villatoro explica que una técnica desarrollada en 2010 permite reconstruir imágenes tridimensionales de la conectividad estructural del encéfalo a partir del análisis de la difusión del agua.
Habla: Francis VillatoroSignificado #12reconstrucción imágenes tridimensionales conectoma estructuraltécnica de difusión del agua 2010imagen 3d conectividad encéfalo 2025…dibujados como pequeños cilindros. ¿Cindritos que se curvan? y los coloreo con diferentes colores en función de la región de la que parten a la región a la que van y tengo una representación de la conectividad estructural de un encéfalo debido a esos axones. Esa es la técnica a nivel del año 2010; ahora en 2025, desde hace dos o tres años, se ha construido, se ha logrado obtener no solo un pequeño ángulo para la imagen en 2D, sino una imagen 3D en. La que tengo vóxeles, en lugar de tener imágenes planas hago una reconstrucción en pequeños volúmenes; en lugar de píxeles tengo vóxeles y en esos píxeles yo tengo una estimación de la anisotropía en las tres direcciones coordenadas. En la dirección…